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Cluster: HRGMv2_1581_CGC9

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_1581_10 HRGMv2_1581_10_33 37025 37363 - 4.A.3.1.2
TF HRGMv2_1581_10 HRGMv2_1581_10_34 37578 38612 - LacI
TC HRGMv2_1581_10 HRGMv2_1581_10_35 38939 40714 + 4.A.3.1.1
CAZyme HRGMv2_1581_10 HRGMv2_1581_10_36 40781 42220 + GH1
TF HRGMv2_1581_10 HRGMv2_1581_10_37 42495 43505 - LacI
TC HRGMv2_1581_10 HRGMv2_1581_10_38 43758 45536 + 4.A.3.1.1
CAZyme HRGMv2_1581_10 HRGMv2_1581_10_39 45612 47033 + GH1
TF HRGMv2_1581_10 HRGMv2_1581_10_40 47546 48310 - HTH_DeoR
sulfatase HRGMv2_1581_10 HRGMv2_1581_10_41 48517 49569 + S1_4
CAZyme HRGMv2_1581_10 HRGMv2_1581_10_42 49746 50915 - CE9
STP HRGMv2_1581_10 HRGMv2_1581_10_43 51034 52200 - SIS | SIS
TF HRGMv2_1581_10 HRGMv2_1581_10_44 52312 53046 - GntR
TC HRGMv2_1581_10 HRGMv2_1581_10_45 53134 53562 - 4.A.6.1.8
NULL(UNKNOWN) HRGMv2_1581_10 HRGMv2_1581_10_46 53641 54264 - NULL(UNKNOWN)
[View Structural Homologs]
TC HRGMv2_1581_10 HRGMv2_1581_10_47 54453 55292 - 4.A.6.1.18
TC HRGMv2_1581_10 HRGMv2_1581_10_48 55282 56169 - 4.A.6.1.18
TC HRGMv2_1581_10 HRGMv2_1581_10_49 56263 56727 - 4.A.6.1.18
CAZyme HRGMv2_1581_10 HRGMv2_1581_10_50 56730 58526 - GH35
TC HRGMv2_1581_10 HRGMv2_1581_10_51 58930 59412 - 4.A.6.1.5
pfam HRGMv2_1581_10 HRGMv2_1581_10_52 59859 60332 - DUF386
CAZyme HRGMv2_1581_10 HRGMv2_1581_10_53 60365 61534 - CE9
Gene ID: HRGMv2_1581_10_33
Type: TC
Location: 37025 - 37363 (-)
Gene ID: HRGMv2_1581_10_34
Type: TF
Location: 37578 - 38612 (-)
Gene ID: HRGMv2_1581_10_35
Type: TC
Location: 38939 - 40714 (+)
Gene ID: HRGMv2_1581_10_36
Type: CAZyme
Location: 40781 - 42220 (+)
Gene ID: HRGMv2_1581_10_37
Type: TF
Location: 42495 - 43505 (-)
Gene ID: HRGMv2_1581_10_38
Type: TC
Location: 43758 - 45536 (+)
Gene ID: HRGMv2_1581_10_39
Type: CAZyme
Location: 45612 - 47033 (+)
Gene ID: HRGMv2_1581_10_40
Type: TF
Location: 47546 - 48310 (-)
Gene ID: HRGMv2_1581_10_41
Type: sulfatase
Location: 48517 - 49569 (+)
Gene ID: HRGMv2_1581_10_42
Type: CAZyme
Location: 49746 - 50915 (-)
Gene ID: HRGMv2_1581_10_43
Type: STP
Location: 51034 - 52200 (-)
Gene ID: HRGMv2_1581_10_44
Type: TF
Location: 52312 - 53046 (-)
Gene ID: HRGMv2_1581_10_45
Type: TC
Location: 53134 - 53562 (-)
Gene ID: HRGMv2_1581_10_46
Type:
Location: 53641 - 54264 (-)
Gene ID: HRGMv2_1581_10_47
Type: TC
Location: 54453 - 55292 (-)
Gene ID: HRGMv2_1581_10_48
Type: TC
Location: 55282 - 56169 (-)
Gene ID: HRGMv2_1581_10_49
Type: TC
Location: 56263 - 56727 (-)
Gene ID: HRGMv2_1581_10_50
Type: CAZyme
Location: 56730 - 58526 (-)
Gene ID: HRGMv2_1581_10_51
Type: TC
Location: 58930 - 59412 (-)
Gene ID: HRGMv2_1581_10_52
Type: pfam
Location: 59859 - 60332 (-)
Gene ID: HRGMv2_1581_10_53
Type: CAZyme
Location: 60365 - 61534 (-)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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Differentially Abundant Genes

Gene ID Condition Pair log2FC FDR P-value
HRGMv2_1581_10_47 vegetarian > vegan 2.53004 0.02517
HRGMv2_1581_10_49 vegetarian > vegan 3.30933 0.02517
HRGMv2_1581_10_50 vegetarian > vegan 2.71608 0.02517

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