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Cluster: HRGMv2_1571_CGC3

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
CAZyme HRGMv2_1571_1 HRGMv2_1571_1_149 162253 163629 - GH13_20
TC HRGMv2_1571_1 HRGMv2_1571_1_150 163784 164980 - 2.A.1.2.18
TC HRGMv2_1571_1 HRGMv2_1571_1_151 165101 167461 - 9.A.8.1.6
NULL(UNKNOWN) HRGMv2_1571_1 HRGMv2_1571_1_152 167583 167903 - NULL(UNKNOWN)
[View Structural Homologs]
peptidase HRGMv2_1571_1 HRGMv2_1571_1_153 167951 168850 - S09.UPW
TC HRGMv2_1571_1 HRGMv2_1571_1_154 169094 169657 + 4.A.1.2.6
pfam HRGMv2_1571_1 HRGMv2_1571_1_155 169839 171242 + tRNA-synt_2 | tRNA_anti-codon
NULL(UNKNOWN) HRGMv2_1571_1 HRGMv2_1571_1_156 171492 172277 + NULL(UNKNOWN)
[View Structural Homologs]
TC HRGMv2_1571_1 HRGMv2_1571_1_157 172438 173418 + 3.A.1.34.1
TC HRGMv2_1571_1 HRGMv2_1571_1_158 173623 174546 + 3.A.1.34.1
TC HRGMv2_1571_1 HRGMv2_1571_1_159 174539 175333 + 3.A.1.34.1
Gene ID: HRGMv2_1571_1_149
Type: CAZyme
Location: 162253 - 163629 (-)
Gene ID: HRGMv2_1571_1_150
Type: TC
Location: 163784 - 164980 (-)
Gene ID: HRGMv2_1571_1_151
Type: TC
Location: 165101 - 167461 (-)
Gene ID: HRGMv2_1571_1_152
Type:
Location: 167583 - 167903 (-)
Gene ID: HRGMv2_1571_1_153
Type: peptidase
Location: 167951 - 168850 (-)
Gene ID: HRGMv2_1571_1_154
Type: TC
Location: 169094 - 169657 (+)
Gene ID: HRGMv2_1571_1_155
Type: pfam
Location: 169839 - 171242 (+)
Gene ID: HRGMv2_1571_1_156
Type:
Location: 171492 - 172277 (+)
Gene ID: HRGMv2_1571_1_157
Type: TC
Location: 172438 - 173418 (+)
Gene ID: HRGMv2_1571_1_158
Type: TC
Location: 173623 - 174546 (+)
Gene ID: HRGMv2_1571_1_159
Type: TC
Location: 174539 - 175333 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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