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Cluster: HRGMv2_1552_CGC8

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_1552_12 HRGMv2_1552_12_28 35601 37277 + 3.A.1.5.35
TC HRGMv2_1552_12 HRGMv2_1552_12_29 37434 38471 + 3.A.1.5.37
TC HRGMv2_1552_12 HRGMv2_1552_12_30 38486 39421 + 3.A.1.5.11
TC HRGMv2_1552_12 HRGMv2_1552_12_31 39424 40515 + 3.A.1.5.34
TC HRGMv2_1552_12 HRGMv2_1552_12_32 40515 40874 + 3.A.1.5.36
TC HRGMv2_1552_12 HRGMv2_1552_12_33 40893 41543 + 3.A.1.5.20
STP HRGMv2_1552_12 HRGMv2_1552_12_34 42291 44636 + GAF | SpoIIE
STP HRGMv2_1552_12 HRGMv2_1552_12_35 44715 45461 + STAS
CAZyme HRGMv2_1552_12 HRGMv2_1552_12_36 46392 48125 + GH13_30
Gene ID: HRGMv2_1552_12_28
Type: TC
Location: 35601 - 37277 (+)
Gene ID: HRGMv2_1552_12_29
Type: TC
Location: 37434 - 38471 (+)
Gene ID: HRGMv2_1552_12_30
Type: TC
Location: 38486 - 39421 (+)
Gene ID: HRGMv2_1552_12_31
Type: TC
Location: 39424 - 40515 (+)
Gene ID: HRGMv2_1552_12_32
Type: TC
Location: 40515 - 40874 (+)
Gene ID: HRGMv2_1552_12_33
Type: TC
Location: 40893 - 41543 (+)
Gene ID: HRGMv2_1552_12_34
Type: STP
Location: 42291 - 44636 (+)
Gene ID: HRGMv2_1552_12_35
Type: STP
Location: 44715 - 45461 (+)
Gene ID: HRGMv2_1552_12_36
Type: CAZyme
Location: 46392 - 48125 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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