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Cluster: HRGMv2_1535_CGC3

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_1535_2 HRGMv2_1535_2_31 33052 33759 + 1.C.82.1.1
pfam HRGMv2_1535_2 HRGMv2_1535_2_32 33885 34595 - Metallophos | Metallophos_2
pfam HRGMv2_1535_2 HRGMv2_1535_2_33 34592 36508 - Bmp
TC HRGMv2_1535_2 HRGMv2_1535_2_34 36601 37368 - 1.A.23.4.10
pfam HRGMv2_1535_2 HRGMv2_1535_2_35 37497 39527 - Metallophos | 5_nucleotid_C
TC HRGMv2_1535_2 HRGMv2_1535_2_36 39600 40394 - 3.A.1.34.1
TC HRGMv2_1535_2 HRGMv2_1535_2_37 40387 41310 - 3.A.1.34.1
TC HRGMv2_1535_2 HRGMv2_1535_2_38 41515 42495 - 3.A.1.34.1
NULL(UNKNOWN) HRGMv2_1535_2 HRGMv2_1535_2_39 42656 43441 - NULL(UNKNOWN)
[View Structural Homologs]
pfam HRGMv2_1535_2 HRGMv2_1535_2_40 43691 45094 - tRNA-synt_2 | tRNA_anti-codon
TC HRGMv2_1535_2 HRGMv2_1535_2_41 45276 45839 - 4.A.1.2.6
peptidase HRGMv2_1535_2 HRGMv2_1535_2_42 46083 46985 + S09.UPW
TC HRGMv2_1535_2 HRGMv2_1535_2_43 47241 49601 + 9.A.8.1.6
TC HRGMv2_1535_2 HRGMv2_1535_2_44 49722 50918 + 2.A.1.2.18
CAZyme HRGMv2_1535_2 HRGMv2_1535_2_45 51071 52447 + GH13_20
Gene ID: HRGMv2_1535_2_31
Type: TC
Location: 33052 - 33759 (+)
Gene ID: HRGMv2_1535_2_32
Type: pfam
Location: 33885 - 34595 (-)
Gene ID: HRGMv2_1535_2_33
Type: pfam
Location: 34592 - 36508 (-)
Gene ID: HRGMv2_1535_2_34
Type: TC
Location: 36601 - 37368 (-)
Gene ID: HRGMv2_1535_2_35
Type: pfam
Location: 37497 - 39527 (-)
Gene ID: HRGMv2_1535_2_36
Type: TC
Location: 39600 - 40394 (-)
Gene ID: HRGMv2_1535_2_37
Type: TC
Location: 40387 - 41310 (-)
Gene ID: HRGMv2_1535_2_38
Type: TC
Location: 41515 - 42495 (-)
Gene ID: HRGMv2_1535_2_39
Type:
Location: 42656 - 43441 (-)
Gene ID: HRGMv2_1535_2_40
Type: pfam
Location: 43691 - 45094 (-)
Gene ID: HRGMv2_1535_2_41
Type: TC
Location: 45276 - 45839 (-)
Gene ID: HRGMv2_1535_2_42
Type: peptidase
Location: 46083 - 46985 (+)
Gene ID: HRGMv2_1535_2_43
Type: TC
Location: 47241 - 49601 (+)
Gene ID: HRGMv2_1535_2_44
Type: TC
Location: 49722 - 50918 (+)
Gene ID: HRGMv2_1535_2_45
Type: CAZyme
Location: 51071 - 52447 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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Differentially Abundant Genes

Gene ID Condition Pair log2FC FDR P-value
HRGMv2_1535_2_35 vegan > omnivore 1.77068 0.00566
HRGMv2_1535_2_35 vegetarian > omnivore 1.36652 0.01287

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