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Cluster: HRGMv2_1535_CGC11

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
CAZyme HRGMv2_1535_11 HRGMv2_1535_11_6 5480 6910 - GH1
pfam HRGMv2_1535_11 HRGMv2_1535_11_7 7322 8230 - ROK
CAZyme HRGMv2_1535_11 HRGMv2_1535_11_8 8255 9742 - GH1
TC HRGMv2_1535_11 HRGMv2_1535_11_9 9828 10169 - 4.A.3.2.1
TC HRGMv2_1535_11 HRGMv2_1535_11_10 10172 10468 - 4.A.3.2.6
TC HRGMv2_1535_11 HRGMv2_1535_11_11 10517 11809 - 4.A.3.2.2
pfam HRGMv2_1535_11 HRGMv2_1535_11_12 11964 12731 - YdjC
TF HRGMv2_1535_11 HRGMv2_1535_11_13 13019 13840 + HTH_6
CAZyme HRGMv2_1535_11 HRGMv2_1535_11_14 13861 15249 - GH1
Gene ID: HRGMv2_1535_11_6
Type: CAZyme
Location: 5480 - 6910 (-)
Gene ID: HRGMv2_1535_11_7
Type: pfam
Location: 7322 - 8230 (-)
Gene ID: HRGMv2_1535_11_8
Type: CAZyme
Location: 8255 - 9742 (-)
Gene ID: HRGMv2_1535_11_9
Type: TC
Location: 9828 - 10169 (-)
Gene ID: HRGMv2_1535_11_10
Type: TC
Location: 10172 - 10468 (-)
Gene ID: HRGMv2_1535_11_11
Type: TC
Location: 10517 - 11809 (-)
Gene ID: HRGMv2_1535_11_12
Type: pfam
Location: 11964 - 12731 (-)
Gene ID: HRGMv2_1535_11_13
Type: TF
Location: 13019 - 13840 (+)
Gene ID: HRGMv2_1535_11_14
Type: CAZyme
Location: 13861 - 15249 (-)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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