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Cluster: HRGMv2_1503_CGC1

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_1503_1 HRGMv2_1503_1_23 20474 21181 + 1.C.82.1.1
pfam HRGMv2_1503_1 HRGMv2_1503_1_24 21309 22019 - Metallophos | Metallophos_2
pfam HRGMv2_1503_1 HRGMv2_1503_1_25 22016 23932 - Bmp
TC HRGMv2_1503_1 HRGMv2_1503_1_26 24026 24793 - 1.A.23.4.10
pfam HRGMv2_1503_1 HRGMv2_1503_1_27 24921 26951 - Metallophos | 5_nucleotid_C
TC HRGMv2_1503_1 HRGMv2_1503_1_28 27024 27818 - 3.A.1.34.1
TC HRGMv2_1503_1 HRGMv2_1503_1_29 27811 28734 - 3.A.1.34.1
TC HRGMv2_1503_1 HRGMv2_1503_1_30 28939 29919 - 3.A.1.34.1
NULL(UNKNOWN) HRGMv2_1503_1 HRGMv2_1503_1_31 30080 30862 - NULL(UNKNOWN)
[View Structural Homologs]
pfam HRGMv2_1503_1 HRGMv2_1503_1_32 31121 32524 - tRNA-synt_2 | tRNA_anti-codon
TC HRGMv2_1503_1 HRGMv2_1503_1_33 32706 33269 - 4.A.1.2.6
peptidase HRGMv2_1503_1 HRGMv2_1503_1_34 33514 34416 + S09.UPW
TC HRGMv2_1503_1 HRGMv2_1503_1_35 34672 37032 + 9.A.8.1.6
TC HRGMv2_1503_1 HRGMv2_1503_1_36 37154 38350 + 2.A.1.2.18
CAZyme HRGMv2_1503_1 HRGMv2_1503_1_37 38533 39909 + GH13_20
Gene ID: HRGMv2_1503_1_23
Type: TC
Location: 20474 - 21181 (+)
Gene ID: HRGMv2_1503_1_24
Type: pfam
Location: 21309 - 22019 (-)
Gene ID: HRGMv2_1503_1_25
Type: pfam
Location: 22016 - 23932 (-)
Gene ID: HRGMv2_1503_1_26
Type: TC
Location: 24026 - 24793 (-)
Gene ID: HRGMv2_1503_1_27
Type: pfam
Location: 24921 - 26951 (-)
Gene ID: HRGMv2_1503_1_28
Type: TC
Location: 27024 - 27818 (-)
Gene ID: HRGMv2_1503_1_29
Type: TC
Location: 27811 - 28734 (-)
Gene ID: HRGMv2_1503_1_30
Type: TC
Location: 28939 - 29919 (-)
Gene ID: HRGMv2_1503_1_31
Type:
Location: 30080 - 30862 (-)
Gene ID: HRGMv2_1503_1_32
Type: pfam
Location: 31121 - 32524 (-)
Gene ID: HRGMv2_1503_1_33
Type: TC
Location: 32706 - 33269 (-)
Gene ID: HRGMv2_1503_1_34
Type: peptidase
Location: 33514 - 34416 (+)
Gene ID: HRGMv2_1503_1_35
Type: TC
Location: 34672 - 37032 (+)
Gene ID: HRGMv2_1503_1_36
Type: TC
Location: 37154 - 38350 (+)
Gene ID: HRGMv2_1503_1_37
Type: CAZyme
Location: 38533 - 39909 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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Differentially Abundant Genes

Gene ID Condition Pair log2FC FDR P-value
HRGMv2_1503_1_27 vegan > omnivore 2.09070 0.00701
HRGMv2_1503_1_27 vegetarian > omnivore 1.55984 0.01285

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