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Cluster: HRGMv2_1435_CGC14

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
CAZyme HRGMv2_1435_35 HRGMv2_1435_35_8 6644 8020 - GH13_20
TC HRGMv2_1435_35 HRGMv2_1435_35_9 8174 9370 - 2.A.1.2.18
TC HRGMv2_1435_35 HRGMv2_1435_35_10 9491 11851 - 9.A.8.1.6
pfam HRGMv2_1435_35 HRGMv2_1435_35_11 12197 12565 - Peptidase_S9
peptidase HRGMv2_1435_35 HRGMv2_1435_35_12 12593 13099 - S09.UPW
TC HRGMv2_1435_35 HRGMv2_1435_35_13 13346 13909 + 4.A.1.2.6
TC HRGMv2_1435_35 HRGMv2_1435_35_14 14144 16078 + 9.B.97.5.1
pfam HRGMv2_1435_35 HRGMv2_1435_35_15 16215 17618 + tRNA-synt_2 | tRNA_anti-codon
pfam HRGMv2_1435_35 HRGMv2_1435_35_16 17866 18654 + WYL
TC HRGMv2_1435_35 HRGMv2_1435_35_17 18814 19794 + 3.A.1.34.1
TC HRGMv2_1435_35 HRGMv2_1435_35_18 19999 20922 + 3.A.1.34.1
TC HRGMv2_1435_35 HRGMv2_1435_35_19 20915 21709 + 3.A.1.34.1
Gene ID: HRGMv2_1435_35_8
Type: CAZyme
Location: 6644 - 8020 (-)
Gene ID: HRGMv2_1435_35_9
Type: TC
Location: 8174 - 9370 (-)
Gene ID: HRGMv2_1435_35_10
Type: TC
Location: 9491 - 11851 (-)
Gene ID: HRGMv2_1435_35_11
Type: pfam
Location: 12197 - 12565 (-)
Gene ID: HRGMv2_1435_35_12
Type: peptidase
Location: 12593 - 13099 (-)
Gene ID: HRGMv2_1435_35_13
Type: TC
Location: 13346 - 13909 (+)
Gene ID: HRGMv2_1435_35_14
Type: TC
Location: 14144 - 16078 (+)
Gene ID: HRGMv2_1435_35_15
Type: pfam
Location: 16215 - 17618 (+)
Gene ID: HRGMv2_1435_35_16
Type: pfam
Location: 17866 - 18654 (+)
Gene ID: HRGMv2_1435_35_17
Type: TC
Location: 18814 - 19794 (+)
Gene ID: HRGMv2_1435_35_18
Type: TC
Location: 19999 - 20922 (+)
Gene ID: HRGMv2_1435_35_19
Type: TC
Location: 20915 - 21709 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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Differentially Abundant Genes

Gene ID Condition Pair log2FC FDR P-value
HRGMv2_1435_35_14 vegan > omnivore 1.31895 0.01332
HRGMv2_1435_35_14 vegetarian > omnivore 1.53159 0.04808

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