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Cluster: HRGMv2_1042_CGC3

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_1042_1 HRGMv2_1042_1_149 158471 160810 - 3.A.3.5.15
STP HRGMv2_1042_1 HRGMv2_1042_1_150 161285 163369 - Pkinase
STP HRGMv2_1042_1 HRGMv2_1042_1_151 163541 164503 - FHA
TC HRGMv2_1042_1 HRGMv2_1042_1_152 165103 167346 + 1.I.1.1.3
STP HRGMv2_1042_1 HRGMv2_1042_1_153 167965 168726 + Fer4
TC HRGMv2_1042_1 HRGMv2_1042_1_154 169070 169582 + 4.A.1.2.11
pfam HRGMv2_1042_1 HRGMv2_1042_1_155 169589 170455 + PRD | PRD | CAT_RBD
TC HRGMv2_1042_1 HRGMv2_1042_1_156 170555 172171 + 4.A.1.1.3
CAZyme HRGMv2_1042_1 HRGMv2_1042_1_157 172175 173557 + GH4
Gene ID: HRGMv2_1042_1_149
Type: TC
Location: 158471 - 160810 (-)
Gene ID: HRGMv2_1042_1_150
Type: STP
Location: 161285 - 163369 (-)
Gene ID: HRGMv2_1042_1_151
Type: STP
Location: 163541 - 164503 (-)
Gene ID: HRGMv2_1042_1_152
Type: TC
Location: 165103 - 167346 (+)
Gene ID: HRGMv2_1042_1_153
Type: STP
Location: 167965 - 168726 (+)
Gene ID: HRGMv2_1042_1_154
Type: TC
Location: 169070 - 169582 (+)
Gene ID: HRGMv2_1042_1_155
Type: pfam
Location: 169589 - 170455 (+)
Gene ID: HRGMv2_1042_1_156
Type: TC
Location: 170555 - 172171 (+)
Gene ID: HRGMv2_1042_1_157
Type: CAZyme
Location: 172175 - 173557 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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