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Cluster: HRGMv2_1032_CGC2

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_1032_1 HRGMv2_1032_1_57 60516 61997 + 3.A.1.8.1
TC HRGMv2_1032_1 HRGMv2_1032_1_58 62001 63071 + 3.A.1.1.3
pfam HRGMv2_1032_1 HRGMv2_1032_1_59 63517 64800 + HGD-D
pfam HRGMv2_1032_1 HRGMv2_1032_1_60 64954 66117 + HGD-D
TC HRGMv2_1032_1 HRGMv2_1032_1_61 66202 67791 + 3.A.1.5.20
TC HRGMv2_1032_1 HRGMv2_1032_1_62 67883 68863 + 3.A.1.5.20
TC HRGMv2_1032_1 HRGMv2_1032_1_63 68856 69692 + 3.A.1.5.20
TC HRGMv2_1032_1 HRGMv2_1032_1_64 69700 70677 + 3.A.1.5.2
TC HRGMv2_1032_1 HRGMv2_1032_1_65 70679 71635 + 3.A.1.5.37
pfam HRGMv2_1032_1 HRGMv2_1032_1_66 71686 72450 + BcrAD_BadFG
CAZyme HRGMv2_1032_1 HRGMv2_1032_1_67 72463 73707 + GT4
Gene ID: HRGMv2_1032_1_57
Type: TC
Location: 60516 - 61997 (+)
Gene ID: HRGMv2_1032_1_58
Type: TC
Location: 62001 - 63071 (+)
Gene ID: HRGMv2_1032_1_59
Type: pfam
Location: 63517 - 64800 (+)
Gene ID: HRGMv2_1032_1_60
Type: pfam
Location: 64954 - 66117 (+)
Gene ID: HRGMv2_1032_1_61
Type: TC
Location: 66202 - 67791 (+)
Gene ID: HRGMv2_1032_1_62
Type: TC
Location: 67883 - 68863 (+)
Gene ID: HRGMv2_1032_1_63
Type: TC
Location: 68856 - 69692 (+)
Gene ID: HRGMv2_1032_1_64
Type: TC
Location: 69700 - 70677 (+)
Gene ID: HRGMv2_1032_1_65
Type: TC
Location: 70679 - 71635 (+)
Gene ID: HRGMv2_1032_1_66
Type: pfam
Location: 71686 - 72450 (+)
Gene ID: HRGMv2_1032_1_67
Type: CAZyme
Location: 72463 - 73707 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

🧭 Explore Read Mapping of CGC

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