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Cluster: HRGMv2_1021_CGC3

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_1021_2 HRGMv2_1021_2_21 23689 24396 + 1.C.82.1.1
pfam HRGMv2_1021_2 HRGMv2_1021_2_22 24524 25234 - Metallophos | Metallophos_2
pfam HRGMv2_1021_2 HRGMv2_1021_2_23 25231 27147 - Bmp
TC HRGMv2_1021_2 HRGMv2_1021_2_24 27241 28008 - 1.A.23.4.10
pfam HRGMv2_1021_2 HRGMv2_1021_2_25 28137 30167 - Metallophos | 5_nucleotid_C
TC HRGMv2_1021_2 HRGMv2_1021_2_26 30236 31030 - 3.A.1.34.1
TC HRGMv2_1021_2 HRGMv2_1021_2_27 31023 31946 - 3.A.1.34.1
TC HRGMv2_1021_2 HRGMv2_1021_2_28 32136 33116 - 3.A.1.34.1
NULL(UNKNOWN) HRGMv2_1021_2 HRGMv2_1021_2_29 33277 34062 - NULL(UNKNOWN)
[View Structural Homologs]
pfam HRGMv2_1021_2 HRGMv2_1021_2_30 34312 35715 - tRNA-synt_2 | tRNA_anti-codon
TC HRGMv2_1021_2 HRGMv2_1021_2_31 35897 36460 - 4.A.1.2.6
peptidase HRGMv2_1021_2 HRGMv2_1021_2_32 36705 37604 + S09.UPW
NULL(UNKNOWN) HRGMv2_1021_2 HRGMv2_1021_2_33 37652 37972 + NULL(UNKNOWN)
[View Structural Homologs]
TC HRGMv2_1021_2 HRGMv2_1021_2_34 38094 40454 + 9.A.8.1.6
TC HRGMv2_1021_2 HRGMv2_1021_2_35 40575 41771 + 2.A.1.2.18
CAZyme HRGMv2_1021_2 HRGMv2_1021_2_36 41926 43302 + GH13_20
Gene ID: HRGMv2_1021_2_21
Type: TC
Location: 23689 - 24396 (+)
Gene ID: HRGMv2_1021_2_22
Type: pfam
Location: 24524 - 25234 (-)
Gene ID: HRGMv2_1021_2_23
Type: pfam
Location: 25231 - 27147 (-)
Gene ID: HRGMv2_1021_2_24
Type: TC
Location: 27241 - 28008 (-)
Gene ID: HRGMv2_1021_2_25
Type: pfam
Location: 28137 - 30167 (-)
Gene ID: HRGMv2_1021_2_26
Type: TC
Location: 30236 - 31030 (-)
Gene ID: HRGMv2_1021_2_27
Type: TC
Location: 31023 - 31946 (-)
Gene ID: HRGMv2_1021_2_28
Type: TC
Location: 32136 - 33116 (-)
Gene ID: HRGMv2_1021_2_29
Type:
Location: 33277 - 34062 (-)
Gene ID: HRGMv2_1021_2_30
Type: pfam
Location: 34312 - 35715 (-)
Gene ID: HRGMv2_1021_2_31
Type: TC
Location: 35897 - 36460 (-)
Gene ID: HRGMv2_1021_2_32
Type: peptidase
Location: 36705 - 37604 (+)
Gene ID: HRGMv2_1021_2_33
Type:
Location: 37652 - 37972 (+)
Gene ID: HRGMv2_1021_2_34
Type: TC
Location: 38094 - 40454 (+)
Gene ID: HRGMv2_1021_2_35
Type: TC
Location: 40575 - 41771 (+)
Gene ID: HRGMv2_1021_2_36
Type: CAZyme
Location: 41926 - 43302 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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Differentially Abundant Genes

Gene ID Condition Pair log2FC FDR P-value
HRGMv2_1021_2_25 vegan > omnivore 1.98817 0.01047
HRGMv2_1021_2_25 vegetarian > omnivore 1.52466 0.02254

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