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Cluster: HRGMv2_1012_CGC2

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
CAZyme HRGMv2_1012_1 HRGMv2_1012_1_137 149846 151222 - GH13_20
TC HRGMv2_1012_1 HRGMv2_1012_1_138 151456 152652 - 2.A.1.2.18
pfam HRGMv2_1012_1 HRGMv2_1012_1_139 152756 153238 - tRNA_edit
TC HRGMv2_1012_1 HRGMv2_1012_1_140 153334 155691 - 9.A.8.1.6
peptidase HRGMv2_1012_1 HRGMv2_1012_1_141 156071 156973 - S09.UPW
TC HRGMv2_1012_1 HRGMv2_1012_1_142 157218 157781 + 4.A.1.2.6
pfam HRGMv2_1012_1 HRGMv2_1012_1_143 157964 159367 + tRNA-synt_2 | tRNA_anti-codon
NULL(UNKNOWN) HRGMv2_1012_1 HRGMv2_1012_1_144 159618 160406 + NULL(UNKNOWN)
[View Structural Homologs]
TC HRGMv2_1012_1 HRGMv2_1012_1_145 160566 161546 + 3.A.1.34.1
TC HRGMv2_1012_1 HRGMv2_1012_1_146 161751 162674 + 3.A.1.34.1
TC HRGMv2_1012_1 HRGMv2_1012_1_147 162667 163461 + 3.A.1.34.1
pfam HRGMv2_1012_1 HRGMv2_1012_1_148 163535 165577 + Metallophos | 5_nucleotid_C
TC HRGMv2_1012_1 HRGMv2_1012_1_149 165708 166475 + 1.A.23.4.10
pfam HRGMv2_1012_1 HRGMv2_1012_1_150 166570 168486 + Bmp
pfam HRGMv2_1012_1 HRGMv2_1012_1_151 168483 169193 + Metallophos | Metallophos_2
TC HRGMv2_1012_1 HRGMv2_1012_1_152 169321 170028 - 1.C.82.1.1
Gene ID: HRGMv2_1012_1_137
Type: CAZyme
Location: 149846 - 151222 (-)
Gene ID: HRGMv2_1012_1_138
Type: TC
Location: 151456 - 152652 (-)
Gene ID: HRGMv2_1012_1_139
Type: pfam
Location: 152756 - 153238 (-)
Gene ID: HRGMv2_1012_1_140
Type: TC
Location: 153334 - 155691 (-)
Gene ID: HRGMv2_1012_1_141
Type: peptidase
Location: 156071 - 156973 (-)
Gene ID: HRGMv2_1012_1_142
Type: TC
Location: 157218 - 157781 (+)
Gene ID: HRGMv2_1012_1_143
Type: pfam
Location: 157964 - 159367 (+)
Gene ID: HRGMv2_1012_1_144
Type:
Location: 159618 - 160406 (+)
Gene ID: HRGMv2_1012_1_145
Type: TC
Location: 160566 - 161546 (+)
Gene ID: HRGMv2_1012_1_146
Type: TC
Location: 161751 - 162674 (+)
Gene ID: HRGMv2_1012_1_147
Type: TC
Location: 162667 - 163461 (+)
Gene ID: HRGMv2_1012_1_148
Type: pfam
Location: 163535 - 165577 (+)
Gene ID: HRGMv2_1012_1_149
Type: TC
Location: 165708 - 166475 (+)
Gene ID: HRGMv2_1012_1_150
Type: pfam
Location: 166570 - 168486 (+)
Gene ID: HRGMv2_1012_1_151
Type: pfam
Location: 168483 - 169193 (+)
Gene ID: HRGMv2_1012_1_152
Type: TC
Location: 169321 - 170028 (-)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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Differentially Abundant Genes

Gene ID Condition Pair log2FC FDR P-value
HRGMv2_1012_1_148 vegan > omnivore 1.82087 0.00566
HRGMv2_1012_1_148 vegetarian > omnivore 1.36524 0.01882

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