Cluster: HRGMv2_1012_CGC10

🧬 Cluster Details

Gene Type	Contig ID	Protein ID	Start	Stop	Direction	Protein Family
TC	HRGMv2_1012_6	HRGMv2_1012_6_58	60449	61891	+	3.A.1.8.1
TC	HRGMv2_1012_6	HRGMv2_1012_6_59	61895	62965	+	3.A.1.1.3
pfam	HRGMv2_1012_6	HRGMv2_1012_6_60	63416	64699	+	HGD-D
TC	HRGMv2_1012_6	HRGMv2_1012_6_61	64935	66548	+	3.A.1.5.11
TC	HRGMv2_1012_6	HRGMv2_1012_6_62	66636	67589	+	3.A.1.5.11
TC	HRGMv2_1012_6	HRGMv2_1012_6_63	67589	68416	+	3.A.1.5.39
TC	HRGMv2_1012_6	HRGMv2_1012_6_64	68420	69418	+	3.A.1.5.35
TC	HRGMv2_1012_6	HRGMv2_1012_6_65	69405	70190	+	3.A.1.5.36
pfam	HRGMv2_1012_6	HRGMv2_1012_6_66	70269	71432	+	HGD-D
pfam	HRGMv2_1012_6	HRGMv2_1012_6_67	71484	72248	+	BcrAD_BadFG
CAZyme	HRGMv2_1012_6	HRGMv2_1012_6_68	72263	73507	+	GT4

Gene ID: HRGMv2_1012_6_58
Type: TC
Location: 60449 - 61891 (+)

Gene ID: HRGMv2_1012_6_59
Type: TC
Location: 61895 - 62965 (+)

Gene ID: HRGMv2_1012_6_60
Type: pfam
Location: 63416 - 64699 (+)

Gene ID: HRGMv2_1012_6_61
Type: TC
Location: 64935 - 66548 (+)

Gene ID: HRGMv2_1012_6_62
Type: TC
Location: 66636 - 67589 (+)

Gene ID: HRGMv2_1012_6_63
Type: TC
Location: 67589 - 68416 (+)

Gene ID: HRGMv2_1012_6_64
Type: TC
Location: 68420 - 69418 (+)

Gene ID: HRGMv2_1012_6_65
Type: TC
Location: 69405 - 70190 (+)

Gene ID: HRGMv2_1012_6_66
Type: pfam
Location: 70269 - 71432 (+)

Gene ID: HRGMv2_1012_6_67
Type: pfam
Location: 71484 - 72248 (+)

Gene ID: HRGMv2_1012_6_68
Type: CAZyme
Location: 72263 - 73507 (+)

Taxonomic Lineage

Domain

→

Phylum

→

Class

→

Order

→

Family

→

Genus

→

Gene Level Read Mapping

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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Gene ID	Condition Pair	log2FC	FDR P-value
HRGMv2_1012_6_61	vegan > omnivore	2.73972	0.00566
HRGMv2_1012_6_62	vegan > omnivore	2.58878	0.00566
HRGMv2_1012_6_63	vegan > omnivore	2.96012	0.00566
HRGMv2_1012_6_64	vegan > omnivore	1.53178	0.00566
HRGMv2_1012_6_65	vegan > omnivore	2.50900	0.00566