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Cluster: HRGMv2_1010_CGC10

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_1010_11 HRGMv2_1010_11_11 11020 12714 + 4.A.3.1.1
STP HRGMv2_1010_11 HRGMv2_1010_11_12 12877 13215 + DeoRC
pfam HRGMv2_1010_11 HRGMv2_1010_11_13 13253 14485 - Fic
CAZyme HRGMv2_1010_11 HRGMv2_1010_11_14 14853 16274 - GH1
TC HRGMv2_1010_11 HRGMv2_1010_11_15 16350 18128 - 4.A.3.1.1
TF HRGMv2_1010_11 HRGMv2_1010_11_16 18404 19414 + LacI
TC HRGMv2_1010_11 HRGMv2_1010_11_17 19752 21512 - 4.A.3.1.1
CAZyme HRGMv2_1010_11 HRGMv2_1010_11_18 21689 23131 - GH1
TF HRGMv2_1010_11 HRGMv2_1010_11_19 23473 24510 + LacI
CAZyme HRGMv2_1010_11 HRGMv2_1010_11_20 24788 26227 - GH1
TC HRGMv2_1010_11 HRGMv2_1010_11_21 26294 28060 - 4.A.3.1.1
TF HRGMv2_1010_11 HRGMv2_1010_11_22 28418 29422 + LacI
TC HRGMv2_1010_11 HRGMv2_1010_11_23 29636 29974 + 4.A.3.1.2
Gene ID: HRGMv2_1010_11_11
Type: TC
Location: 11020 - 12714 (+)
Gene ID: HRGMv2_1010_11_12
Type: STP
Location: 12877 - 13215 (+)
Gene ID: HRGMv2_1010_11_13
Type: pfam
Location: 13253 - 14485 (-)
Gene ID: HRGMv2_1010_11_14
Type: CAZyme
Location: 14853 - 16274 (-)
Gene ID: HRGMv2_1010_11_15
Type: TC
Location: 16350 - 18128 (-)
Gene ID: HRGMv2_1010_11_16
Type: TF
Location: 18404 - 19414 (+)
Gene ID: HRGMv2_1010_11_17
Type: TC
Location: 19752 - 21512 (-)
Gene ID: HRGMv2_1010_11_18
Type: CAZyme
Location: 21689 - 23131 (-)
Gene ID: HRGMv2_1010_11_19
Type: TF
Location: 23473 - 24510 (+)
Gene ID: HRGMv2_1010_11_20
Type: CAZyme
Location: 24788 - 26227 (-)
Gene ID: HRGMv2_1010_11_21
Type: TC
Location: 26294 - 28060 (-)
Gene ID: HRGMv2_1010_11_22
Type: TF
Location: 28418 - 29422 (+)
Gene ID: HRGMv2_1010_11_23
Type: TC
Location: 29636 - 29974 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

🧭 Explore Read Mapping of CGC

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