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Cluster: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_CGC8

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
CAZyme CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858_143 138342 140042 + GH13_20
TF CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858_144 140379 141050 + Trans_reg_C
STP CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858_145 141047 142231 + HATPase_c | HisKA
TC CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858_146 142301 142981 + 3.A.1.134.12
pfam CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858_147 142987 145200 + FtsX | FtsX
TF CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858_148 145302 146135 + HTH_AraC
TC CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858_149 146150 147340 + 2.A.1.21.22
pfam CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858_150 147470 148030 + Acetyltransf_1 | Acetyltransf_4
TF CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858_151 148127 148441 + HTH_5
TC CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858_152 148532 149533 + 2.A.119.1.3
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858_143
Type: CAZyme
Location: 138342 - 140042 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858_144
Type: TF
Location: 140379 - 141050 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858_145
Type: STP
Location: 141047 - 142231 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858_146
Type: TC
Location: 142301 - 142981 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858_147
Type: pfam
Location: 142987 - 145200 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858_148
Type: TF
Location: 145302 - 146135 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858_149
Type: TC
Location: 146150 - 147340 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858_150
Type: pfam
Location: 147470 - 148030 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858_151
Type: TF
Location: 148127 - 148441 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858_152
Type: TC
Location: 148532 - 149533 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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