Cluster: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_CGC27
🧬 Cluster Details
- Gene Count: 8
- CAZyme Count: 1
- Substrate:
- Genome ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19
- CGC Family ID: CGCFAM_00222
- Continent: North America
- Source Study: Zeng et al., 2022 →
| Gene Type | Contig ID | Protein ID | Start | Stop | Direction | Protein Family |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TC | CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_41059 | CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_41059_74 | 77528 | 78520 | + | 8.A.5.1.4 |
| TF | CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_41059 | CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_41059_75 | 78696 | 79448 | + | HTH_DeoR |
| TC | CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_41059 | CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_41059_76 | 79525 | 80874 | + | 2.A.23.1.2 |
| pfam | CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_41059 | CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_41059_77 | 81054 | 81302 | + | VEG |
| CAZyme | CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_41059 | CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_41059_78 | 81397 | 82959 | + | CBM50 |
| pfam | CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_41059 | CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_41059_79 | 83061 | 83924 | + | GHMP_kinases_N | GHMP_kinases_C |
| TF | CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_41059 | CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_41059_80 | 83946 | 84620 | + | GntR |
| TC | CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_41059 | CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_41059_81 | 84877 | 86388 | + | 9.A.11.1.2 |
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_41059_74
Type: TC
Location: 77528 - 78520 (+)
Type: TC
Location: 77528 - 78520 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_41059_75
Type: TF
Location: 78696 - 79448 (+)
Type: TF
Location: 78696 - 79448 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_41059_76
Type: TC
Location: 79525 - 80874 (+)
Type: TC
Location: 79525 - 80874 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_41059_77
Type: pfam
Location: 81054 - 81302 (+)
Type: pfam
Location: 81054 - 81302 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_41059_78
Type: CAZyme
Location: 81397 - 82959 (+)
Type: CAZyme
Location: 81397 - 82959 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_41059_79
Type: pfam
Location: 83061 - 83924 (+)
Type: pfam
Location: 83061 - 83924 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_41059_80
Type: TF
Location: 83946 - 84620 (+)
Type: TF
Location: 83946 - 84620 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_41059_81
Type: TC
Location: 84877 - 86388 (+)
Type: TC
Location: 84877 - 86388 (+)
Taxonomic Lineage
Domain
Bacteria
Phylum
Bacillota_A
Class
Clostridia
Order
Lachnospirales
Family
Lachnospiraceae
Genus
Anaerostipes
Species
Anaerostipes sp900756035
Gene Level Read Mapping
Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)
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Differentially Abundant Genes
| Gene ID | Condition Pair | log2FC | FDR P-value |
|---|---|---|---|
| CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_41059_77 | vegan > omnivore | 1.68536 | 0.00574 |