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Cluster: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_CGC20

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
CAZyme CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009_173 193466 194479 + GH177
TC CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009_174 194530 195921 + 2.A.2.3.3
pfam CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009_175 195962 196861 + AP_endonuc_2
TF CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009_176 197011 198036 + LacI
CAZyme CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009_177 198228 199232 + GH177
pfam CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009_178 199289 200119 + AP_endonuc_2
TC CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009_179 200136 201569 + 2.A.2.3.3
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009_173
Type: CAZyme
Location: 193466 - 194479 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009_174
Type: TC
Location: 194530 - 195921 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009_175
Type: pfam
Location: 195962 - 196861 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009_176
Type: TF
Location: 197011 - 198036 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009_177
Type: CAZyme
Location: 198228 - 199232 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009_178
Type: pfam
Location: 199289 - 200119 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009_179
Type: TC
Location: 200136 - 201569 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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Differentially Abundant Genes

Gene ID Condition Pair log2FC FDR P-value
CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009_175 vegan > omnivore 1.29204 0.00574
CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009_177 vegan > omnivore 2.57322 0.00574
CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009_177 vegetarian > omnivore 2.08271 0.02528
CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009_178 vegan > omnivore 4.95508 0.00574
CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009_178 vegetarian > omnivore 4.17019 0.02017

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