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Cluster: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_CGC18

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009_44 52009 52770 + 2.A.79.1.4
pfam CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009_45 52767 53222 + ThrE | ThrE_2
peptidase CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009_46 53247 54953 + S08.UPA
CAZyme CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009_47 55073 57529 + GT35
TC CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009_48 57692 59464 + 3.A.11.1.4
STP CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009_49 59610 60263 + TPR_2
TC CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009_50 60473 60907 + 4.A.6.1.16
TC CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009_51 60904 61383 + 4.A.6.1.16
TC CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009_52 61408 62226 + 4.A.6.1.3
TC CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009_53 62241 63062 + 4.A.6.1.3
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009_44
Type: TC
Location: 52009 - 52770 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009_45
Type: pfam
Location: 52767 - 53222 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009_46
Type: peptidase
Location: 53247 - 54953 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009_47
Type: CAZyme
Location: 55073 - 57529 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009_48
Type: TC
Location: 57692 - 59464 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009_49
Type: STP
Location: 59610 - 60263 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009_50
Type: TC
Location: 60473 - 60907 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009_51
Type: TC
Location: 60904 - 61383 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009_52
Type: TC
Location: 61408 - 62226 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009_53
Type: TC
Location: 62241 - 63062 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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Differentially Abundant Genes

Gene ID Condition Pair log2FC FDR P-value
CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009_51 vegan > omnivore 3.44624 0.00574
CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_33009_53 vegan > omnivore 3.54558 0.00574

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