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Cluster: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_CGC10

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858_196 195523 196887 + 2.A.66.1.32
pfam CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858_197 196934 197662 + SIR2
pfam CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858_198 197667 198032 + NusG_II
TC CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858_199 198042 198542 + 2.A.87.3.1
pfam CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858_200 198555 199634 + ApbE
TC CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858_201 199659 201041 + 2.A.25.1.5
pfam CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858_202 201106 202041 + Mem_trans | Mem_trans
TF CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858_203 202195 203709 - HTH_3
CAZyme CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858_204 203936 204913 + GH179
TF CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858_205 204955 205722 + HTH_DeoR
TC CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858_206 206054 206974 + 8.A.5.1.7
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858_196
Type: TC
Location: 195523 - 196887 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858_197
Type: pfam
Location: 196934 - 197662 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858_198
Type: pfam
Location: 197667 - 198032 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858_199
Type: TC
Location: 198042 - 198542 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858_200
Type: pfam
Location: 198555 - 199634 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858_201
Type: TC
Location: 199659 - 201041 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858_202
Type: pfam
Location: 201106 - 202041 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858_203
Type: TF
Location: 202195 - 203709 (-)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858_204
Type: CAZyme
Location: 203936 - 204913 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858_205
Type: TF
Location: 204955 - 205722 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_17858_206
Type: TC
Location: 206054 - 206974 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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