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Cluster: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_CGC1

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852_13 16436 18298 + 9.B.18.2.1
STP CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852_14 18313 19449 + Aminotran_1_2
TC CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852_15 19470 21716 + 9.B.18.1.1
pfam CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852_16 21709 22371 + PglD_N
CAZyme CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852_17 22358 23458 + GT4
TC CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852_18 23471 24580 + 9.B.183.1.9
CAZyme CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852_19 24942 25760 + GT2
CAZyme CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852_20 25782 26918 + GT4
pfam CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852_21 26915 27457 + Hexapep | Hexapep_2
CAZyme CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852_22 27466 28455 + GT2
CAZyme CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852_23 28468 29448 + GT2
CAZyme CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852_24 29450 30421 + GT2
CAZyme CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852_25 30447 31463 + GT32
CAZyme CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852_26 31465 32427 + GT2
pfam CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852_27 32442 33608 + Glyco_transf_61
pfam CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852_28 33641 34738 + PS_pyruv_trans
TC CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852_29 34762 35628 + 3.A.1.103.6
TC CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852_30 35643 36920 + 3.A.1.103.5
CAZyme CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852 CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852_31 36932 38032 + GT2
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852_13
Type: TC
Location: 16436 - 18298 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852_14
Type: STP
Location: 18313 - 19449 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852_15
Type: TC
Location: 19470 - 21716 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852_16
Type: pfam
Location: 21709 - 22371 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852_17
Type: CAZyme
Location: 22358 - 23458 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852_18
Type: TC
Location: 23471 - 24580 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852_19
Type: CAZyme
Location: 24942 - 25760 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852_20
Type: CAZyme
Location: 25782 - 26918 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852_21
Type: pfam
Location: 26915 - 27457 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852_22
Type: CAZyme
Location: 27466 - 28455 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852_23
Type: CAZyme
Location: 28468 - 29448 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852_24
Type: CAZyme
Location: 29450 - 30421 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852_25
Type: CAZyme
Location: 30447 - 31463 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852_26
Type: CAZyme
Location: 31465 - 32427 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852_27
Type: pfam
Location: 32442 - 33608 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852_28
Type: pfam
Location: 33641 - 34738 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852_29
Type: TC
Location: 34762 - 35628 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852_30
Type: TC
Location: 35643 - 36920 (+)
Gene ID: CokerMO_2019_SRR8692240_bin.19_k141_8852_31
Type: CAZyme
Location: 36932 - 38032 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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