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Cluster: CGMR083912_CGC66

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC k141_40496 k141_40496_312 334847 336157 + 3.A.1.1.4
TC k141_40496 k141_40496_313 336188 337072 + 3.A.1.1.4
TC k141_40496 k141_40496_314 337094 337909 + 3.A.1.1.4
NULL(UNKNOWN) k141_40496 k141_40496_315 338151 339197 + NULL(UNKNOWN)
[View Structural Homologs]
pfam k141_40496 k141_40496_316 339425 340261 + PRD | PRD | CAT_RBD
TC k141_40496 k141_40496_317 340378 342249 + 4.A.1.2.11
CAZyme k141_40496 k141_40496_318 342266 343693 + GH1
TF k141_40496 k141_40496_319 343774 344721 - HTH_AraC | HTH_AraC
STP k141_40496 k141_40496_320 344836 346113 + SBP_bac_1
TC k141_40496 k141_40496_321 346185 347051 + 3.A.1.1.45
TC k141_40496 k141_40496_322 347048 347923 + 3.A.1.1.45
CAZyme k141_40496 k141_40496_323 347936 350218 + GH31_3
TC k141_40496 k141_40496_324 350328 352031 - 8.A.59.2.1
TF k141_40496 k141_40496_325 352028 353551 - HTH_AraC | HTH_AraC
TC k141_40496 k141_40496_326 353720 355009 + 3.A.1.1.4
TC k141_40496 k141_40496_327 355071 355946 + 3.A.1.1.4
TC k141_40496 k141_40496_328 355943 356764 + 3.A.1.1.4
CAZyme k141_40496 k141_40496_329 356805 358997 + GH36
pfam k141_40496 k141_40496_330 359189 359467 + Fer4_19
pfam k141_40496 k141_40496_331 359455 359727 + Acetyltransf_1 | Acetyltransf_7 | Acetyltransf_10 | Acetyltransf_CG
TC k141_40496 k141_40496_332 359797 361551 - 3.A.1.135.5
TC k141_40496 k141_40496_333 361548 363278 - 3.A.1.135.5
Gene ID: k141_40496_312
Type: TC
Location: 334847 - 336157 (+)
Gene ID: k141_40496_313
Type: TC
Location: 336188 - 337072 (+)
Gene ID: k141_40496_314
Type: TC
Location: 337094 - 337909 (+)
Gene ID: k141_40496_315
Type:
Location: 338151 - 339197 (+)
Gene ID: k141_40496_316
Type: pfam
Location: 339425 - 340261 (+)
Gene ID: k141_40496_317
Type: TC
Location: 340378 - 342249 (+)
Gene ID: k141_40496_318
Type: CAZyme
Location: 342266 - 343693 (+)
Gene ID: k141_40496_319
Type: TF
Location: 343774 - 344721 (-)
Gene ID: k141_40496_320
Type: STP
Location: 344836 - 346113 (+)
Gene ID: k141_40496_321
Type: TC
Location: 346185 - 347051 (+)
Gene ID: k141_40496_322
Type: TC
Location: 347048 - 347923 (+)
Gene ID: k141_40496_323
Type: CAZyme
Location: 347936 - 350218 (+)
Gene ID: k141_40496_324
Type: TC
Location: 350328 - 352031 (-)
Gene ID: k141_40496_325
Type: TF
Location: 352028 - 353551 (-)
Gene ID: k141_40496_326
Type: TC
Location: 353720 - 355009 (+)
Gene ID: k141_40496_327
Type: TC
Location: 355071 - 355946 (+)
Gene ID: k141_40496_328
Type: TC
Location: 355943 - 356764 (+)
Gene ID: k141_40496_329
Type: CAZyme
Location: 356805 - 358997 (+)
Gene ID: k141_40496_330
Type: pfam
Location: 359189 - 359467 (+)
Gene ID: k141_40496_331
Type: pfam
Location: 359455 - 359727 (+)
Gene ID: k141_40496_332
Type: TC
Location: 359797 - 361551 (-)
Gene ID: k141_40496_333
Type: TC
Location: 361548 - 363278 (-)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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