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Cluster: CGMR060615_CGC2

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
CAZyme k141_31341 k141_31341_7 8909 9850 + GT2
CAZyme k141_31341 k141_31341_8 9847 11034 + GT2
CAZyme k141_31341 k141_31341_9 11050 12174 + GT4
CAZyme k141_31341 k141_31341_10 12639 13754 + GT94
CAZyme k141_31341 k141_31341_11 13794 14759 + GT2
TC k141_31341 k141_31341_12 14752 16221 + 2.A.66.2.23
NULL(UNKNOWN) k141_31341 k141_31341_13 16221 17345 + NULL(UNKNOWN)
[View Structural Homologs]
CAZyme k141_31341 k141_31341_14 17338 18498 + GT4
CAZyme k141_31341 k141_31341_15 18498 19346 + GT2
pfam k141_31341 k141_31341_16 19346 20881 + Polysacc_deac_3
pfam k141_31341 k141_31341_17 20889 21674 + MetW | Methyltransf_11 | Methyltransf_23 | Methyltransf_25 | Methyltransf_31
CAZyme k141_31341 k141_31341_18 21671 22885 + GT2
STP k141_31341 k141_31341_19 23003 25684 + HATPase_c | HisKA | Response_reg
pfam k141_31341 k141_31341_20 25805 26932 + Exo_endo_phos
TC k141_31341 k141_31341_21 27070 30456 - 1.B.14.6.3
TC k141_31341 k141_31341_22 30671 32359 - 3.A.1.120.6
CAZyme k141_31341 k141_31341_23 32677 34647 - GH13_14
CAZyme k141_31341 k141_31341_24 34916 36361 + GH13_5
TC k141_31341 k141_31341_25 36450 37526 - 1.A.23.4.2
pfam k141_31341 k141_31341_26 37892 38503 - OMP_b-brl
NULL(UNKNOWN) k141_31341 k141_31341_27 38504 38800 - NULL(UNKNOWN)
[View Structural Homologs]
TC k141_31341 k141_31341_28 38836 39087 - 1.E.43.1.10
Gene ID: k141_31341_7
Type: CAZyme
Location: 8909 - 9850 (+)
Gene ID: k141_31341_8
Type: CAZyme
Location: 9847 - 11034 (+)
Gene ID: k141_31341_9
Type: CAZyme
Location: 11050 - 12174 (+)
Gene ID: k141_31341_10
Type: CAZyme
Location: 12639 - 13754 (+)
Gene ID: k141_31341_11
Type: CAZyme
Location: 13794 - 14759 (+)
Gene ID: k141_31341_12
Type: TC
Location: 14752 - 16221 (+)
Gene ID: k141_31341_13
Type:
Location: 16221 - 17345 (+)
Gene ID: k141_31341_14
Type: CAZyme
Location: 17338 - 18498 (+)
Gene ID: k141_31341_15
Type: CAZyme
Location: 18498 - 19346 (+)
Gene ID: k141_31341_16
Type: pfam
Location: 19346 - 20881 (+)
Gene ID: k141_31341_17
Type: pfam
Location: 20889 - 21674 (+)
Gene ID: k141_31341_18
Type: CAZyme
Location: 21671 - 22885 (+)
Gene ID: k141_31341_19
Type: STP
Location: 23003 - 25684 (+)
Gene ID: k141_31341_20
Type: pfam
Location: 25805 - 26932 (+)
Gene ID: k141_31341_21
Type: TC
Location: 27070 - 30456 (-)
Gene ID: k141_31341_22
Type: TC
Location: 30671 - 32359 (-)
Gene ID: k141_31341_23
Type: CAZyme
Location: 32677 - 34647 (-)
Gene ID: k141_31341_24
Type: CAZyme
Location: 34916 - 36361 (+)
Gene ID: k141_31341_25
Type: TC
Location: 36450 - 37526 (-)
Gene ID: k141_31341_26
Type: pfam
Location: 37892 - 38503 (-)
Gene ID: k141_31341_27
Type:
Location: 38504 - 38800 (-)
Gene ID: k141_31341_28
Type: TC
Location: 38836 - 39087 (-)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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Differentially Abundant Genes

Gene ID Condition Pair log2FC FDR P-value
k141_31341_21 vegan > omnivore 1.79129 0.00701
k141_31341_21 vegetarian > omnivore 1.19377 0.02695
k141_31341_24 vegan > omnivore 2.44156 0.00701

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