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Cluster: CGMR051453_CGC8

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC k141_401161 k141_401161_19 19525 19788 + 8.A.8.1.4
pfam k141_401161 k141_401161_20 19862 21700 + GIY-YIG | UVR | UvrC_RNaseH_dom | HHH_2 | HHH_5 | UvrC_RNaseH
TC k141_401161 k141_401161_21 21733 22575 - 3.A.1.1.18
TC k141_401161 k141_401161_22 22595 23530 - 3.A.1.1.4
STP k141_401161 k141_401161_23 23607 24902 - SBP_bac_1
pfam k141_401161 k141_401161_24 25080 26498 - PGM_PMM_IV | PGM_PMM_I | PGM_PMM_II | PGM_PMM_III
CAZyme k141_401161 k141_401161_25 26514 28913 - GH94
NULL(UNKNOWN) k141_401161 k141_401161_26 29141 30457 + NULL(UNKNOWN)
[View Structural Homologs]
pfam k141_401161 k141_401161_27 30436 31281 + DUF4130
TC k141_401161 k141_401161_28 31370 32074 + 3.A.1.122.7
pfam k141_401161 k141_401161_29 32068 35259 + FtsX | FtsX | MacB_PCD | MacB_PCD
TC k141_401161 k141_401161_30 35547 36371 - 3.A.1.132.3
TC k141_401161 k141_401161_31 36477 37163 - 9.B.18.1.2
pfam k141_401161 k141_401161_32 37416 39041 - ABC1
NULL(UNKNOWN) k141_401161 k141_401161_33 39016 39363 - NULL(UNKNOWN)
[View Structural Homologs]
TC k141_401161 k141_401161_34 39505 40689 - 3.A.1.11.7
TC k141_401161 k141_401161_35 40746 41549 - 3.A.1.11.2
TC k141_401161 k141_401161_36 41546 42355 - 3.A.1.11.2
TC k141_401161 k141_401161_37 42352 43500 - 3.A.1.11.8
pfam k141_401161 k141_401161_38 43983 44525 - Acetyltransf_1 | Acetyltransf_3 | Acetyltransf_7 | Acetyltransf_8 | Acetyltransf_10
TC k141_401161 k141_401161_39 44587 46161 - 2.A.21.2.3
Gene ID: k141_401161_19
Type: TC
Location: 19525 - 19788 (+)
Gene ID: k141_401161_20
Type: pfam
Location: 19862 - 21700 (+)
Gene ID: k141_401161_21
Type: TC
Location: 21733 - 22575 (-)
Gene ID: k141_401161_22
Type: TC
Location: 22595 - 23530 (-)
Gene ID: k141_401161_23
Type: STP
Location: 23607 - 24902 (-)
Gene ID: k141_401161_24
Type: pfam
Location: 25080 - 26498 (-)
Gene ID: k141_401161_25
Type: CAZyme
Location: 26514 - 28913 (-)
Gene ID: k141_401161_26
Type:
Location: 29141 - 30457 (+)
Gene ID: k141_401161_27
Type: pfam
Location: 30436 - 31281 (+)
Gene ID: k141_401161_28
Type: TC
Location: 31370 - 32074 (+)
Gene ID: k141_401161_29
Type: pfam
Location: 32068 - 35259 (+)
Gene ID: k141_401161_30
Type: TC
Location: 35547 - 36371 (-)
Gene ID: k141_401161_31
Type: TC
Location: 36477 - 37163 (-)
Gene ID: k141_401161_32
Type: pfam
Location: 37416 - 39041 (-)
Gene ID: k141_401161_33
Type:
Location: 39016 - 39363 (-)
Gene ID: k141_401161_34
Type: TC
Location: 39505 - 40689 (-)
Gene ID: k141_401161_35
Type: TC
Location: 40746 - 41549 (-)
Gene ID: k141_401161_36
Type: TC
Location: 41546 - 42355 (-)
Gene ID: k141_401161_37
Type: TC
Location: 42352 - 43500 (-)
Gene ID: k141_401161_38
Type: pfam
Location: 43983 - 44525 (-)
Gene ID: k141_401161_39
Type: TC
Location: 44587 - 46161 (-)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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Differentially Abundant Genes

Gene ID Condition Pair log2FC FDR P-value
k141_401161_19 vegetarian > vegan 1.33060 0.01287

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