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Cluster: CGMR018262_CGC10

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC k141_3141 k141_3141_6 3610 5589 - 4.A.2.1.4
STP k141_3141 k141_3141_7 5630 6538 - PfkB
TC k141_3141 k141_3141_8 6586 7911 - 2.A.35.1.2
pfam k141_3141 k141_3141_9 7970 8803 - DAP_epimerase | DAP_epimerase
TC k141_3141 k141_3141_10 9010 10737 + 8.A.7.1.1
TC k141_3141 k141_3141_11 10852 11112 + 8.A.8.1.1
pfam k141_3141 k141_3141_12 11158 11436 - Trns_repr_metal
CAZyme k141_3141 k141_3141_13 11638 12438 + GT51
pfam k141_3141 k141_3141_14 12699 13910 + Arginosuc_synth | Arginosuc_syn_C
pfam k141_3141 k141_3141_15 13910 15337 + Lyase_1 | ASL_C2
TC k141_3141 k141_3141_16 15789 17120 + 2.A.3.2.1
TC k141_3141 k141_3141_17 17777 18715 + 3.A.1.5.11
TC k141_3141 k141_3141_18 18715 19536 + 3.A.1.5.38
TC k141_3141 k141_3141_19 19623 21188 + 3.A.1.5.3
TC k141_3141 k141_3141_20 21201 21998 + 3.A.1.5.25
TC k141_3141 k141_3141_21 21991 22812 + 3.A.1.5.12
Gene ID: k141_3141_6
Type: TC
Location: 3610 - 5589 (-)
Gene ID: k141_3141_7
Type: STP
Location: 5630 - 6538 (-)
Gene ID: k141_3141_8
Type: TC
Location: 6586 - 7911 (-)
Gene ID: k141_3141_9
Type: pfam
Location: 7970 - 8803 (-)
Gene ID: k141_3141_10
Type: TC
Location: 9010 - 10737 (+)
Gene ID: k141_3141_11
Type: TC
Location: 10852 - 11112 (+)
Gene ID: k141_3141_12
Type: pfam
Location: 11158 - 11436 (-)
Gene ID: k141_3141_13
Type: CAZyme
Location: 11638 - 12438 (+)
Gene ID: k141_3141_14
Type: pfam
Location: 12699 - 13910 (+)
Gene ID: k141_3141_15
Type: pfam
Location: 13910 - 15337 (+)
Gene ID: k141_3141_16
Type: TC
Location: 15789 - 17120 (+)
Gene ID: k141_3141_17
Type: TC
Location: 17777 - 18715 (+)
Gene ID: k141_3141_18
Type: TC
Location: 18715 - 19536 (+)
Gene ID: k141_3141_19
Type: TC
Location: 19623 - 21188 (+)
Gene ID: k141_3141_20
Type: TC
Location: 21201 - 21998 (+)
Gene ID: k141_3141_21
Type: TC
Location: 21991 - 22812 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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