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Cluster: CGMR006697_CGC30

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
CAZyme k141_6161 k141_6161_60 54004 56073 + GH31_4
TC k141_6161 k141_6161_61 56076 56492 + 4.A.6.1.15
TC k141_6161 k141_6161_62 56510 57286 + 4.A.6.1.13
TC k141_6161 k141_6161_63 57279 58094 + 4.A.6.1.13
TC k141_6161 k141_6161_64 58108 58584 + 4.A.6.1.18
TC k141_6161 k141_6161_65 58773 59267 + 4.A.6.1.18
TF k141_6161 k141_6161_66 59378 60589 - 0038701
TC k141_6161 k141_6161_67 60747 62027 + 4.A.3.2.2
pfam k141_6161 k141_6161_68 62040 63935 + DUF4838
TC k141_6161 k141_6161_69 63998 64882 + 3.A.1.1.37
TC k141_6161 k141_6161_70 64890 65693 + 3.A.1.1.39
Gene ID: k141_6161_60
Type: CAZyme
Location: 54004 - 56073 (+)
Gene ID: k141_6161_61
Type: TC
Location: 56076 - 56492 (+)
Gene ID: k141_6161_62
Type: TC
Location: 56510 - 57286 (+)
Gene ID: k141_6161_63
Type: TC
Location: 57279 - 58094 (+)
Gene ID: k141_6161_64
Type: TC
Location: 58108 - 58584 (+)
Gene ID: k141_6161_65
Type: TC
Location: 58773 - 59267 (+)
Gene ID: k141_6161_66
Type: TF
Location: 59378 - 60589 (-)
Gene ID: k141_6161_67
Type: TC
Location: 60747 - 62027 (+)
Gene ID: k141_6161_68
Type: pfam
Location: 62040 - 63935 (+)
Gene ID: k141_6161_69
Type: TC
Location: 63998 - 64882 (+)
Gene ID: k141_6161_70
Type: TC
Location: 64890 - 65693 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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