dbCAN Logo

Cluster: CGMR006485_CGC12

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC k141_41520 k141_41520_5 4409 4924 + 2.A.87.3.2
TC k141_41520 k141_41520_6 4950 6290 + 3.D.6.1.2
TC k141_41520 k141_41520_7 6350 7306 + 3.D.6.1.2
pfam k141_41520 k141_41520_8 7296 7847 + FMN_bind
TC k141_41520 k141_41520_9 7844 8527 + 3.D.6.1.2
TC k141_41520 k141_41520_10 8520 9107 + 3.D.6.1.2
TC k141_41520 k141_41520_11 9150 9962 + 3.D.6.1.1
STP k141_41520 k141_41520_12 10308 10664 - NUDIX
pfam k141_41520 k141_41520_13 11217 12188 + URO-D
TC k141_41520 k141_41520_14 12204 13547 + 2.A.3.3.1
pfam k141_41520 k141_41520_15 13644 14675 - DAHP_synth_1
TF k141_41520 k141_41520_16 14916 15710 - HTH_AraC
CAZyme k141_41520 k141_41520_17 15837 17414 + GH32
CAZyme k141_41520 k141_41520_18 17435 18466 + GH172
Gene ID: k141_41520_5
Type: TC
Location: 4409 - 4924 (+)
Gene ID: k141_41520_6
Type: TC
Location: 4950 - 6290 (+)
Gene ID: k141_41520_7
Type: TC
Location: 6350 - 7306 (+)
Gene ID: k141_41520_8
Type: pfam
Location: 7296 - 7847 (+)
Gene ID: k141_41520_9
Type: TC
Location: 7844 - 8527 (+)
Gene ID: k141_41520_10
Type: TC
Location: 8520 - 9107 (+)
Gene ID: k141_41520_11
Type: TC
Location: 9150 - 9962 (+)
Gene ID: k141_41520_12
Type: STP
Location: 10308 - 10664 (-)
Gene ID: k141_41520_13
Type: pfam
Location: 11217 - 12188 (+)
Gene ID: k141_41520_14
Type: TC
Location: 12204 - 13547 (+)
Gene ID: k141_41520_15
Type: pfam
Location: 13644 - 14675 (-)
Gene ID: k141_41520_16
Type: TF
Location: 14916 - 15710 (-)
Gene ID: k141_41520_17
Type: CAZyme
Location: 15837 - 17414 (+)
Gene ID: k141_41520_18
Type: CAZyme
Location: 17435 - 18466 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

Loading chart...

No differentially abundant genes found in the 2019 study.

🧭 Explore Read Mapping of CGC

← Back to Cluster List