dbCAN Logo

Cluster: BF068_108_CGC64

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC k141_478394 k141_478394_17 19483 19863 + 1.A.77.3.8
TC k141_478394 k141_478394_18 19872 20687 + 3.A.2.1.1
TC k141_478394 k141_478394_19 20736 20975 + 3.A.2.1.1
TC k141_478394 k141_478394_20 21026 21496 + 3.A.2.1.1
TC k141_478394 k141_478394_21 21511 22044 + 3.A.2.1.1
TC k141_478394 k141_478394_22 22057 23598 + 3.A.2.1.1
TC k141_478394 k141_478394_23 23649 24512 + 3.A.2.1.1
TC k141_478394 k141_478394_24 24539 25921 + 3.A.2.1.1
TC k141_478394 k141_478394_25 25942 26361 + 3.A.2.1.1
pfam k141_478394 k141_478394_26 27058 28428 + Hexapep | NTP_transferase | IspD | NTP_transf_3 | Hexapep_2
STP k141_478394 k141_478394_27 28615 30444 + SIS | SIS
TC k141_478394 k141_478394_28 30784 31824 + 3.A.1.7.1
TC k141_478394 k141_478394_29 31953 32912 + 3.A.1.7.1
TC k141_478394 k141_478394_30 32912 33802 + 3.A.1.7.1
TC k141_478394 k141_478394_31 33850 34623 + 3.A.1.7.1
pfam k141_478394 k141_478394_32 34674 35399 + PhoU | PhoU
TC k141_478394 k141_478394_33 35873 37504 + 1.B.3.1.3
CAZyme k141_478394 k141_478394_34 37543 38709 + CE1
pfam k141_478394 k141_478394_35 38884 39549 - Hydrolase | HAD_2
TC k141_478394 k141_478394_36 39719 41056 + 2.A.40.7.6
Gene ID: k141_478394_17
Type: TC
Location: 19483 - 19863 (+)
Gene ID: k141_478394_18
Type: TC
Location: 19872 - 20687 (+)
Gene ID: k141_478394_19
Type: TC
Location: 20736 - 20975 (+)
Gene ID: k141_478394_20
Type: TC
Location: 21026 - 21496 (+)
Gene ID: k141_478394_21
Type: TC
Location: 21511 - 22044 (+)
Gene ID: k141_478394_22
Type: TC
Location: 22057 - 23598 (+)
Gene ID: k141_478394_23
Type: TC
Location: 23649 - 24512 (+)
Gene ID: k141_478394_24
Type: TC
Location: 24539 - 25921 (+)
Gene ID: k141_478394_25
Type: TC
Location: 25942 - 26361 (+)
Gene ID: k141_478394_26
Type: pfam
Location: 27058 - 28428 (+)
Gene ID: k141_478394_27
Type: STP
Location: 28615 - 30444 (+)
Gene ID: k141_478394_28
Type: TC
Location: 30784 - 31824 (+)
Gene ID: k141_478394_29
Type: TC
Location: 31953 - 32912 (+)
Gene ID: k141_478394_30
Type: TC
Location: 32912 - 33802 (+)
Gene ID: k141_478394_31
Type: TC
Location: 33850 - 34623 (+)
Gene ID: k141_478394_32
Type: pfam
Location: 34674 - 35399 (+)
Gene ID: k141_478394_33
Type: TC
Location: 35873 - 37504 (+)
Gene ID: k141_478394_34
Type: CAZyme
Location: 37543 - 38709 (+)
Gene ID: k141_478394_35
Type: pfam
Location: 38884 - 39549 (-)
Gene ID: k141_478394_36
Type: TC
Location: 39719 - 41056 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

Loading chart...

No differentially abundant genes found in the 2019 study.

🧭 Explore Read Mapping of CGC

← Back to Cluster List