dbCAN Logo

Cluster: BF021_42_CGC16

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC k141_40086 k141_40086_45 49594 51735 + 9.B.74.1.1
NULL(UNKNOWN) k141_40086 k141_40086_46 51748 52428 + NULL(UNKNOWN)
[View Structural Homologs]
TC k141_40086 k141_40086_47 52425 54188 + 9.B.74.1.1
STP k141_40086 k141_40086_48 54344 54556 + FeoA
STP k141_40086 k141_40086_49 54573 54794 + FeoA
TC k141_40086 k141_40086_50 54878 57346 + 9.A.8.1.6
pfam k141_40086 k141_40086_51 57378 57521 + FeoB_associated
TF k141_40086 k141_40086_52 57615 58076 + FUR
CAZyme k141_40086 k141_40086_53 58287 60308 + CBM66
TF k141_40086 k141_40086_54 60524 60991 + MarR
TC k141_40086 k141_40086_55 61035 62399 + 2.A.66.1.32
TF k141_40086 k141_40086_56 62450 63940 + GntR
TC k141_40086 k141_40086_57 64030 66141 - 1.B.52.2.1
peptidase k141_40086 k141_40086_58 66161 67051 - S09.UPW
pfam k141_40086 k141_40086_59 67191 67730 + Rubrerythrin | Coat_F
TC k141_40086 k141_40086_60 67988 69430 + 3.A.1.11.8
TC k141_40086 k141_40086_61 69460 70254 + 3.A.1.11.1
TC k141_40086 k141_40086_62 70251 71075 + 3.A.1.11.2
STP k141_40086 k141_40086_63 71068 72573 + SBP_bac_1
pfam k141_40086 k141_40086_64 72823 74040 + Aminotran_3 | Beta_elim_lyase
TC k141_40086 k141_40086_65 74125 74745 + 2.A.115.2.14
TC k141_40086 k141_40086_66 74814 76337 + 2.A.3.5.1
pfam k141_40086 k141_40086_67 76443 77627 + Fe-ADH | Fe-ADH_2 | ADH_Fe_C
TF k141_40086 k141_40086_68 77662 78225 + HTH_3
TC k141_40086 k141_40086_69 78324 78926 - 2.A.115.2.14
TC k141_40086 k141_40086_70 79167 80495 + 2.A.38.4.1
TC k141_40086 k141_40086_71 80507 81154 + 2.A.38.4.6
STP k141_40086 k141_40086_72 81139 82644 + HATPase_c | HisKA
TF k141_40086 k141_40086_73 82687 83385 + Trans_reg_C
TC k141_40086 k141_40086_74 83429 84787 - 2.A.22.5.2
Gene ID: k141_40086_45
Type: TC
Location: 49594 - 51735 (+)
Gene ID: k141_40086_46
Type:
Location: 51748 - 52428 (+)
Gene ID: k141_40086_47
Type: TC
Location: 52425 - 54188 (+)
Gene ID: k141_40086_48
Type: STP
Location: 54344 - 54556 (+)
Gene ID: k141_40086_49
Type: STP
Location: 54573 - 54794 (+)
Gene ID: k141_40086_50
Type: TC
Location: 54878 - 57346 (+)
Gene ID: k141_40086_51
Type: pfam
Location: 57378 - 57521 (+)
Gene ID: k141_40086_52
Type: TF
Location: 57615 - 58076 (+)
Gene ID: k141_40086_53
Type: CAZyme
Location: 58287 - 60308 (+)
Gene ID: k141_40086_54
Type: TF
Location: 60524 - 60991 (+)
Gene ID: k141_40086_55
Type: TC
Location: 61035 - 62399 (+)
Gene ID: k141_40086_56
Type: TF
Location: 62450 - 63940 (+)
Gene ID: k141_40086_57
Type: TC
Location: 64030 - 66141 (-)
Gene ID: k141_40086_58
Type: peptidase
Location: 66161 - 67051 (-)
Gene ID: k141_40086_59
Type: pfam
Location: 67191 - 67730 (+)
Gene ID: k141_40086_60
Type: TC
Location: 67988 - 69430 (+)
Gene ID: k141_40086_61
Type: TC
Location: 69460 - 70254 (+)
Gene ID: k141_40086_62
Type: TC
Location: 70251 - 71075 (+)
Gene ID: k141_40086_63
Type: STP
Location: 71068 - 72573 (+)
Gene ID: k141_40086_64
Type: pfam
Location: 72823 - 74040 (+)
Gene ID: k141_40086_65
Type: TC
Location: 74125 - 74745 (+)
Gene ID: k141_40086_66
Type: TC
Location: 74814 - 76337 (+)
Gene ID: k141_40086_67
Type: pfam
Location: 76443 - 77627 (+)
Gene ID: k141_40086_68
Type: TF
Location: 77662 - 78225 (+)
Gene ID: k141_40086_69
Type: TC
Location: 78324 - 78926 (-)
Gene ID: k141_40086_70
Type: TC
Location: 79167 - 80495 (+)
Gene ID: k141_40086_71
Type: TC
Location: 80507 - 81154 (+)
Gene ID: k141_40086_72
Type: STP
Location: 81139 - 82644 (+)
Gene ID: k141_40086_73
Type: TF
Location: 82687 - 83385 (+)
Gene ID: k141_40086_74
Type: TC
Location: 83429 - 84787 (-)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

Loading chart...

Differentially Abundant Genes

Gene ID Condition Pair log2FC FDR P-value
k141_40086_49 vegan > omnivore 2.02021 0.02115

🧭 Explore Read Mapping of CGC

← Back to Cluster List