CAZyme3D

You are here: Home Cite us: 2025

Entry ID

Information for CAZyme ID: AWI09507.1

Basic Information

GenBank IDAWI09507.1
FamilyPL0
Sequence Length3667
UniProt IDA0A2U8E3N6(100,100)Download
Average pLDDT?47.70
CAZy50 ID167
CAZy50 RepYes, AWI09507.1
Structure Cluster-
EC Number(s)-
Substrates(s)-

Taxonomy

Tax ID1796921
KingdomBacteria
PhylumVerrucomicrobiota
ClassOpitutae
OrderOpitutales
FamilyOpitutaceae
GenusEreboglobus
SpeciesEreboglobus luteus

Protein Sequence:
90 < plddt <=100;
70 < plddt <= 90;
50 < plddt <= 70;
0 <= plddt <= 50;     Download help

MHTTTTPTRI  VRIATLAVAF  AASFATLRAA  PAPTIPSSAY  NLTGFAATTT  GGGVINDTDA60
AYRKVTTALE  FITAIRDSNK  TAGAVKVIEV  MNDLNLGWNE  IGSEAQNLDS  NPARAHAAPK120
LHPTLITSGV  TLLDIKTKGG  GLTIFSANGA  TIKHCTFNIK  NTSNIIIRNL  KFDEMWEWDE180
ATKGDYDSND  WDFITLGNGG  DTTNIWIDHC  TFTSAYDGIT  DMKAKASNVT  YSWCRITGSD240
DAPGGFIRAQ  LDVLEASKSS  HPMYNTLRTK  AGFTIEEIAF  ITRGAKKGIL  MGANSLKAEN300
ANLTATFHHI  LMTNLWDRAI  PRLRGGNVHI  YNVILDDTEA  LAAKRLRDTR  AAALDSAGLS360
ALNKYKFNPP  LNGAISTEDG  AILLEKSIYT  DCLWPLRNNQ  TDPSNAAYTG  KILGLDVIYN420
FDSTTIRGNS  TDDGNPLGPF  QSAIKPFSWS  FADNSQTLPY  TIDNMDDPSV  LPVILEAGAG480
AGVIEWADTD  GKYNWLKTTY  PAAPASDIAP  VITLQPKSQS  VIEGSSVTLS  VSAIASPAPS540
YQWYKDSLPV  AGGTTSTLTI  ASASAASVGA  YYAVVTNGIA  PDATSATATI  SLTSPPAAPV600
AAAATGITGE  GFTANWALSA  NATGYSIDVS  PDPTFANCWP  GYENLAVGNV  ASHAITGLSP660
ATTYYYRVRA  TVGSYSTADS  NAIAAATAAV  ANIPAEVDDP  MDDTDRLSAP  SLTNTRWVVA720
NSASYSQLAA  TTGGITWTLA  SANGTLAVGY  FPKVTVPVGE  TLTATLEFTP  GTAGATADGF780
RFAFLSSGSD  GILSNDVTSG  TNDVFKTHTG  YALFSKSGNV  GGGSTAALAV  DAYRRNDSPG840
TPADLLSKSG  DWTKQSSSSG  ASGNLVAGST  YKLVFQVLNN  GSSLTVTESL  TGPGLSNVSA900
SFTDNAPAAN  YFDAIALRFA  KGSNQFGSIT  LNSLKVTGGV  VETAVDPLPA  IYSAPTASGA960
QGAAFNYACV  STNGATSYSA  TGLPSGLSIN  ASTGVISGTP  AEYGSFDAIV  TASNANGAGA1020
DFTLTLTIEP  EPAAAPVAAE  ATARTAEGFT  ANWTAVPGAT  SYQLDIATDS  GFTTMVAGYE1080
ELNVGDVTSY  AVTGLDAATT  YYYRVSAVTE  SVVGNASATI  TVVTAGEGGG  YLVNDSFTDA1140
DRIGGTDGSS  THKTNGPFVA  TPSSANTQWV  ANQVSTLVAT  GTGLVWGYTG  TSSATALGYF1200
PDVTVQSGVP  MTIALTFTTG  TTGGTVNNIP  NNLRIGLIND  TASGRANNDG  ISSTDARFEG1260
DTGYAVFSAS  SVVGGGSTAD  IGLKTYKRTP  TDDKKTDLIN  TDVNWTSLGA  STGATGNLGV1320
NTSYTLTFTL  NYNGSKMTIN  TKLAGGDLAG  FDYTVEDETS  PVLTFNTIAF  RLGKGVGQFS1380
EINFTNLKIW  EGAEPASGPA  APTLAEPNSI  TAEGFTANWN  TAAGATGYYL  DVSTDPDFGS1440
FVSGYENLYV  GNNLSHAITG  LTAGVTYYYR  VRAANADGTS  ASTGASTAVV  TTGGGGNTYL1500
VNDSFTDYDR  IGGFDGSATA  PDAPLVGTPT  ATNTQWVASS  TNTLVATGTG  MVWNYAGTGN1560
SMTIGYFPEV  TVANSGTVTV  QLKFTTGVVG  TGTNNLRIAL  INDTPNGRFE  TDGVSSASDY1620
YKGDTGYAIM  SAASNIGNAT  ANLVLRTYKH  INLETTDLLG  TAGNWGTATG  TTSQIGNSSG1680
STGYFQGETD  YTLTLTLAKN  TSGTEMTIGT  KLEGGNFTGL  EYSVVDRDTT  VAIPGSFNAL1740
AFRLGGSTTQ  FDHLKFTSLK  VWEGDEPAPV  AAAPVITCPA  TASATQGAAF  TYNITAINSP1800
TSYALASGAL  PAGVTLNTST  GVISGTPTES  GTFNVTLTAT  NDIGASAPHS  LAITVATAIT1860
EPPVINSETT  ATAVIGAAFT  YTITATNEPS  SFAATGLPAS  GNLQLDTATG  VISGTAAVGD1920
LGTHTVVLTA  TNAIGASAPV  TLTLTVELPP  ALSAPVALPA  TGETTTGFIA  RWEAVTGADS1980
YRLDVATDAG  FTSLVSGYGD  LNIGTMTGRM  VTGLSADTDY  YYRVRAVNEA  GPSASSNTGA2040
ARTASSEVVL  VDDSFNDTDR  IGGFDGTSTS  SSSPAINTPT  SANTQWVIGN  AGQLIATTGG2100
MNWNFLVTNA  VSALGYFPTV  NVANGTTVTL  RLKFTTGTLG  GATSGNNFRI  VMIDSSPNGY2160
RQTDGAGSTA  DPFIGDKGYA  FFMPSPVAGA  STMPVTLQSF  KRTALTSDNL  FGSDASWTRS2220
NSVTQADGHR  FASNTAYTLT  ITLTRSSATS  ITTNAVITGG  NFDNLICEIA  DADTPVTKFD2280
TLGLRFGAGI  NQFNQITLNS  LRITTTGSSE  VTEPPVITSA  LTASATRGAA  FSYTIVADNV2340
PTSFTAEGLP  SGLELETSTG  VISGTPTATG  SYAVTIGAHN  AIGSDTRELI  ITVTAGGSDI2400
TTIVPPSGGL  TSPASTVFDA  AGNAYIADIA  AGAIMKVAGD  GTVTTFATIP  QLAVVAADSS2460
GNLYAAGNDG  NVTKILADGT  VVSPALATGV  TTPGGIAVDS  DGNVYVSKTA  SNTIVKITPA2520
GAVSTLAGSG  SAGSADATGD  AASFNGPTGL  ALNGNTGTLY  VADTVNCTIR  AIDLATGTVT2580
TVAGRAGVAG  DIGSEGSDGK  ATDGTLDTPE  AITIDAAGLL  YIADTGNNLI  RGFDPVSGAL2640
TTLAGDSGSI  TLVAPAGLAF  NPVSGLLNVA  DTGNGALRAV  TIKPVIAAQI  VDRIAKLGTT2700
VTLDGTAWAS  PAASYQWSVH  GTALAGSEAT  ITINVKSVTD  SGVYTIAASN  TAGESTAGMR2760
LTVTGNDSTQ  GPNDNSPNMN  DSGGGGGAPS  LWILGAMALL  ALVRKFSARR  MPAKLLPLLV2820
FLSFLAIHTS  PFAIAQQATP  SAELPPDDEI  ITMSAFEVTG  QSIKGYTASE  SVTGTRVASL2880
LRDLPFNVNV  VTDEFIADFN  AFDLADQLSN  VSSFSPSENI  GQFQLRGFEA  STQLVDGFRR2940
VGLTGVTVTD  RVEVIKGPAA  SIYGAIQPGG  AVNTLRKKPA  AKPKYGLTLG  VGTHDQARAS3000
FYATGPVGNS  KKLFYRLDTE  YRRTERQQEF  TRTRNGYAAL  QLAYKPTSRT  TLSVFIDHAD3060
RHDHPVSQLA  TSAARVDIGN  LPSWFPYDTS  DLRRTWAKYF  TQYFAQDFDY  YDMNFYGPTA3120
AKYSRLTSGS  VTLDHKVNSL  WSIRASFNMS  TNLSHTENAN  IGYYPFGYGV  INAATTEPPT3180
AEVRITPKHA  ETTNKATGFQ  LDNLFRFDTG  PIKHQLLVTG  DYYRNSSREF  SATWSNAFFY3240
DPADPYNLAG  NPSYASWDYA  TWDDDRSPYN  RVGDNSKVIN  RNYGLFVSER  ATMFKGRLIA3300
MAGVRYDYVD  CTATHMPTDD  NYTTKVVDYS  PDSWTYQLGL  TAVINRNITA  YVNASSAFDP3360
QPQLDEYDNP  LPNKESDGYE  FGFKFTLFSE  ALNITLNRFY  IRQENLTYSV  NDPETGQKET3420
IVTGEQKAKG  YEIDFNWQLT  RSLNIIGGYG  YVDAEITDAG  KLNWLNNTTP  RRVPKHNLGI3480
SVRYEFVSGP  LKGLFATGGA  TYYSKSLVNA  GSGYNITPYK  GTEDFNRMSQ  ELIYNVRFPN3540
GGLPYPYLPE  NAIVSYFTPA  SGSTPAMLYW  TDNQGATTVD  ELKKYSYASP  YLNGAVYVID3600
GRTQIYNRSS  VVWKMGVGYK  FKARGFGKKL  SHKIQVNMNN  VFNEKSTIGG  GIPILERNVM3660
VTYSVTF3667

Predicted 3D structure by AlphaFold2 with pLDDT = 47.70 ; Download help

pLDDT is for per-residue accuracy of the structure, which representes the quality of the residue. A higher value indicates better prediction accuracy. More detail please see AlphaFold .

Residues were colored according to plddt ( blue-> high quality; red-> low quality ).

Full Sequence:
CAPSIF:V and CAPSIF:G =99.9;
CAPSIF:V =59.9;
CAPSIF:G =40;
Non-Binding=0;     Download help

MHTTTTPTRI  VRIATLAVAF  AASFATLRAA  PAPTIPSSAY  NLTGFAATTT  GGGVINDTDA60
AYRKVTTALE  FITAIRDSNK  TAGAVKVIEV  MNDLNLGWNE  IGSEAQNLDS  NPARAHAAPK120
LHPTLITSGV  TLLDIKTKGG  GLTIFSANGA  TIKHCTFNIK  NTSNIIIRNL  KFDEMWEWDE180
ATKGDYDSND  WDFITLGNGG  DTTNIWIDHC  TFTSAYDGIT  DMKAKASNVT  YSWCRITGSD240
DAPGGFIRAQ  LDVLEASKSS  HPMYNTLRTK  AGFTIEEIAF  ITRGAKKGIL  MGANSLKAEN300
ANLTATFHHI  LMTNLWDRAI  PRLRGGNVHI  YNVILDDTEA  LAAKRLRDTR  AAALDSAGLS360
ALNKYKFNPP  LNGAISTEDG  AILLEKSIYT  DCLWPLRNNQ  TDPSNAAYTG  KILGLDVIYN420
FDSTTIRGNS  TDDGNPLGPF  QSAIKPFSWS  FADNSQTLPY  TIDNMDDPSV  LPVILEAGAG480
AGVIEWADTD  GKYNWLKTTY  PAAPASDIAP  VITLQPKSQS  VIEGSSVTLS  VSAIASPAPS540
YQWYKDSLPV  AGGTTSTLTI  ASASAASVGA  YYAVVTNGIA  PDATSATATI  SLTSPPAAPV600
AAAATGITGE  GFTANWALSA  NATGYSIDVS  PDPTFANCWP  GYENLAVGNV  ASHAITGLSP660
ATTYYYRVRA  TVGSYSTADS  NAIAAATAAV  ANIPAEVDDP  MDDTDRLSAP  SLTNTRWVVA720
NSASYSQLAA  TTGGITWTLA  SANGTLAVGY  FPKVTVPVGE  TLTATLEFTP  GTAGATADGF780
RFAFLSSGSD  GILSNDVTSG  TNDVFKTHTG  YALFSKSGNV  GGGSTAALAV  DAYRRNDSPG840
TPADLLSKSG  DWTKQSSSSG  ASGNLVAGST  YKLVFQVLNN  GSSLTVTESL  TGPGLSNVSA900
SFTDNAPAAN  YFDAIALRFA  KGSNQFGSIT  LNSLKVTGGV  VETAVDPLPA  IYSAPTASGA960
QGAAFNYACV  STNGATSYSA  TGLPSGLSIN  ASTGVISGTP  AEYGSFDAIV  TASNANGAGA1020
DFTLTLTIEP  EPAAAPVAAE  ATARTAEGFT  ANWTAVPGAT  SYQLDIATDS  GFTTMVAGYE1080
ELNVGDVTSY  AVTGLDAATT  YYYRVSAVTE  SVVGNASATI  TVVTAGEGGG  YLVNDSFTDA1140
DRIGGTDGSS  THKTNGPFVA  TPSSANTQWV  ANQVSTLVAT  GTGLVWGYTG  TSSATALGYF1200
PDVTVQSGVP  MTIALTFTTG  TTGGTVNNIP  NNLRIGLIND  TASGRANNDG  ISSTDARFEG1260
DTGYAVFSAS  SVVGGGSTAD  IGLKTYKRTP  TDDKKTDLIN  TDVNWTSLGA  STGATGNLGV1320
NTSYTLTFTL  NYNGSKMTIN  TKLAGGDLAG  FDYTVEDETS  PVLTFNTIAF  RLGKGVGQFS1380
EINFTNLKIW  EGAEPASGPA  APTLAEPNSI  TAEGFTANWN  TAAGATGYYL  DVSTDPDFGS1440
FVSGYENLYV  GNNLSHAITG  LTAGVTYYYR  VRAANADGTS  ASTGASTAVV  TTGGGGNTYL1500
VNDSFTDYDR  IGGFDGSATA  PDAPLVGTPT  ATNTQWVASS  TNTLVATGTG  MVWNYAGTGN1560
SMTIGYFPEV  TVANSGTVTV  QLKFTTGVVG  TGTNNLRIAL  INDTPNGRFE  TDGVSSASDY1620
YKGDTGYAIM  SAASNIGNAT  ANLVLRTYKH  INLETTDLLG  TAGNWGTATG  TTSQIGNSSG1680
STGYFQGETD  YTLTLTLAKN  TSGTEMTIGT  KLEGGNFTGL  EYSVVDRDTT  VAIPGSFNAL1740
AFRLGGSTTQ  FDHLKFTSLK  VWEGDEPAPV  AAAPVITCPA  TASATQGAAF  TYNITAINSP1800
TSYALASGAL  PAGVTLNTST  GVISGTPTES  GTFNVTLTAT  NDIGASAPHS  LAITVATAIT1860
EPPVINSETT  ATAVIGAAFT  YTITATNEPS  SFAATGLPAS  GNLQLDTATG  VISGTAAVGD1920
LGTHTVVLTA  TNAIGASAPV  TLTLTVELPP  ALSAPVALPA  TGETTTGFIA  RWEAVTGADS1980
YRLDVATDAG  FTSLVSGYGD  LNIGTMTGRM  VTGLSADTDY  YYRVRAVNEA  GPSASSNTGA2040
ARTASSEVVL  VDDSFNDTDR  IGGFDGTSTS  SSSPAINTPT  SANTQWVIGN  AGQLIATTGG2100
MNWNFLVTNA  VSALGYFPTV  NVANGTTVTL  RLKFTTGTLG  GATSGNNFRI  VMIDSSPNGY2160
RQTDGAGSTA  DPFIGDKGYA  FFMPSPVAGA  STMPVTLQSF  KRTALTSDNL  FGSDASWTRS2220
NSVTQADGHR  FASNTAYTLT  ITLTRSSATS  ITTNAVITGG  NFDNLICEIA  DADTPVTKFD2280
TLGLRFGAGI  NQFNQITLNS  LRITTTGSSE  VTEPPVITSA  LTASATRGAA  FSYTIVADNV2340
PTSFTAEGLP  SGLELETSTG  VISGTPTATG  SYAVTIGAHN  AIGSDTRELI  ITVTAGGSDI2400
TTIVPPSGGL  TSPASTVFDA  AGNAYIADIA  AGAIMKVAGD  GTVTTFATIP  QLAVVAADSS2460
GNLYAAGNDG  NVTKILADGT  VVSPALATGV  TTPGGIAVDS  DGNVYVSKTA  SNTIVKITPA2520
GAVSTLAGSG  SAGSADATGD  AASFNGPTGL  ALNGNTGTLY  VADTVNCTIR  AIDLATGTVT2580
TVAGRAGVAG  DIGSEGSDGK  ATDGTLDTPE  AITIDAAGLL  YIADTGNNLI  RGFDPVSGAL2640
TTLAGDSGSI  TLVAPAGLAF  NPVSGLLNVA  DTGNGALRAV  TIKPVIAAQI  VDRIAKLGTT2700
VTLDGTAWAS  PAASYQWSVH  GTALAGSEAT  ITINVKSVTD  SGVYTIAASN  TAGESTAGMR2760
LTVTGNDSTQ  GPNDNSPNMN  DSGGGGGAPS  LWILGAMALL  ALVRKFSARR  MPAKLLPLLV2820
FLSFLAIHTS  PFAIAQQATP  SAELPPDDEI  ITMSAFEVTG  QSIKGYTASE  SVTGTRVASL2880
LRDLPFNVNV  VTDEFIADFN  AFDLADQLSN  VSSFSPSENI  GQFQLRGFEA  STQLVDGFRR2940
VGLTGVTVTD  RVEVIKGPAA  SIYGAIQPGG  AVNTLRKKPA  AKPKYGLTLG  VGTHDQARAS3000
FYATGPVGNS  KKLFYRLDTE  YRRTERQQEF  TRTRNGYAAL  QLAYKPTSRT  TLSVFIDHAD3060
RHDHPVSQLA  TSAARVDIGN  LPSWFPYDTS  DLRRTWAKYF  TQYFAQDFDY  YDMNFYGPTA3120
AKYSRLTSGS  VTLDHKVNSL  WSIRASFNMS  TNLSHTENAN  IGYYPFGYGV  INAATTEPPT3180
AEVRITPKHA  ETTNKATGFQ  LDNLFRFDTG  PIKHQLLVTG  DYYRNSSREF  SATWSNAFFY3240
DPADPYNLAG  NPSYASWDYA  TWDDDRSPYN  RVGDNSKVIN  RNYGLFVSER  ATMFKGRLIA3300
MAGVRYDYVD  CTATHMPTDD  NYTTKVVDYS  PDSWTYQLGL  TAVINRNITA  YVNASSAFDP3360
QPQLDEYDNP  LPNKESDGYE  FGFKFTLFSE  ALNITLNRFY  IRQENLTYSV  NDPETGQKET3420
IVTGEQKAKG  YEIDFNWQLT  RSLNIIGGYG  YVDAEITDAG  KLNWLNNTTP  RRVPKHNLGI3480
SVRYEFVSGP  LKGLFATGGA  TYYSKSLVNA  GSGYNITPYK  GTEDFNRMSQ  ELIYNVRFPN3540
GGLPYPYLPE  NAIVSYFTPA  SGSTPAMLYW  TDNQGATTVD  ELKKYSYASP  YLNGAVYVID3600
GRTQIYNRSS  VVWKMGVGYK  FKARGFGKKL  SHKIQVNMNN  VFNEKSTIGG  GIPILERNVM3660
VTYSVTF3667

Carbohydrate binding residues Predicted by CAPSIF from 3D structure; Download help

Residues were colored according to prediction score:

Nonbinder, CAPSIF:G Predicted Binder, CAPSIF:V Predicted Binder, CAPSIF:V and CAPSIF:G Predicted Binder

CArbohydrate–Protein interaction Site IdentiFier (CAPSIF) that predicts non-covalent carbohydrate-binding sites on proteins: (1) a 3D-UNet voxel-based neural network model (CAPSIF:V) and (2) an equivariant graph neural network model (CAPSIF:G).

Details:
⋆B-Factor = 0.0 : Nonbinder.
⋆B-Factor = 40.0 : CAPSIF:G Predicted Binder.
⋆B-Factor = 59.9 : CAPSIF:V Predicted Binder.
⋆B-Factor = 99.9 : CAPSIF:V and CAPSIF:G Predicted Binder.

For more detail please see CAPSIF.

Full Sequence:
AA;
CE;
PL;
GH;
GT;
CBM;     Download structure help

dbCAN3 predicted domain(s) : PL1(141-339)

MHTTTTPTRI  VRIATLAVAF  AASFATLRAA  PAPTIPSSAY  NLTGFAATTT  GGGVINDTDA60
AYRKVTTALE  FITAIRDSNK  TAGAVKVIEV  MNDLNLGWNE  IGSEAQNLDS  NPARAHAAPK120
LHPTLITSGV  TLLDIKTKGG  GLTIFSANGA  TIKHCTFNIK  NTSNIIIRNL  KFDEMWEWDE180
ATKGDYDSND  WDFITLGNGG  DTTNIWIDHC  TFTSAYDGIT  DMKAKASNVT  YSWCRITGSD240
DAPGGFIRAQ  LDVLEASKSS  HPMYNTLRTK  AGFTIEEIAF  ITRGAKKGIL  MGANSLKAEN300
ANLTATFHHI  LMTNLWDRAI  PRLRGGNVHI  YNVILDDTEA  LAAKRLRDTR  AAALDSAGLS360
ALNKYKFNPP  LNGAISTEDG  AILLEKSIYT  DCLWPLRNNQ  TDPSNAAYTG  KILGLDVIYN420
FDSTTIRGNS  TDDGNPLGPF  QSAIKPFSWS  FADNSQTLPY  TIDNMDDPSV  LPVILEAGAG480
AGVIEWADTD  GKYNWLKTTY  PAAPASDIAP  VITLQPKSQS  VIEGSSVTLS  VSAIASPAPS540
YQWYKDSLPV  AGGTTSTLTI  ASASAASVGA  YYAVVTNGIA  PDATSATATI  SLTSPPAAPV600
AAAATGITGE  GFTANWALSA  NATGYSIDVS  PDPTFANCWP  GYENLAVGNV  ASHAITGLSP660
ATTYYYRVRA  TVGSYSTADS  NAIAAATAAV  ANIPAEVDDP  MDDTDRLSAP  SLTNTRWVVA720
NSASYSQLAA  TTGGITWTLA  SANGTLAVGY  FPKVTVPVGE  TLTATLEFTP  GTAGATADGF780
RFAFLSSGSD  GILSNDVTSG  TNDVFKTHTG  YALFSKSGNV  GGGSTAALAV  DAYRRNDSPG840
TPADLLSKSG  DWTKQSSSSG  ASGNLVAGST  YKLVFQVLNN  GSSLTVTESL  TGPGLSNVSA900
SFTDNAPAAN  YFDAIALRFA  KGSNQFGSIT  LNSLKVTGGV  VETAVDPLPA  IYSAPTASGA960
QGAAFNYACV  STNGATSYSA  TGLPSGLSIN  ASTGVISGTP  AEYGSFDAIV  TASNANGAGA1020
DFTLTLTIEP  EPAAAPVAAE  ATARTAEGFT  ANWTAVPGAT  SYQLDIATDS  GFTTMVAGYE1080
ELNVGDVTSY  AVTGLDAATT  YYYRVSAVTE  SVVGNASATI  TVVTAGEGGG  YLVNDSFTDA1140
DRIGGTDGSS  THKTNGPFVA  TPSSANTQWV  ANQVSTLVAT  GTGLVWGYTG  TSSATALGYF1200
PDVTVQSGVP  MTIALTFTTG  TTGGTVNNIP  NNLRIGLIND  TASGRANNDG  ISSTDARFEG1260
DTGYAVFSAS  SVVGGGSTAD  IGLKTYKRTP  TDDKKTDLIN  TDVNWTSLGA  STGATGNLGV1320
NTSYTLTFTL  NYNGSKMTIN  TKLAGGDLAG  FDYTVEDETS  PVLTFNTIAF  RLGKGVGQFS1380
EINFTNLKIW  EGAEPASGPA  APTLAEPNSI  TAEGFTANWN  TAAGATGYYL  DVSTDPDFGS1440
FVSGYENLYV  GNNLSHAITG  LTAGVTYYYR  VRAANADGTS  ASTGASTAVV  TTGGGGNTYL1500
VNDSFTDYDR  IGGFDGSATA  PDAPLVGTPT  ATNTQWVASS  TNTLVATGTG  MVWNYAGTGN1560
SMTIGYFPEV  TVANSGTVTV  QLKFTTGVVG  TGTNNLRIAL  INDTPNGRFE  TDGVSSASDY1620
YKGDTGYAIM  SAASNIGNAT  ANLVLRTYKH  INLETTDLLG  TAGNWGTATG  TTSQIGNSSG1680
STGYFQGETD  YTLTLTLAKN  TSGTEMTIGT  KLEGGNFTGL  EYSVVDRDTT  VAIPGSFNAL1740
AFRLGGSTTQ  FDHLKFTSLK  VWEGDEPAPV  AAAPVITCPA  TASATQGAAF  TYNITAINSP1800
TSYALASGAL  PAGVTLNTST  GVISGTPTES  GTFNVTLTAT  NDIGASAPHS  LAITVATAIT1860
EPPVINSETT  ATAVIGAAFT  YTITATNEPS  SFAATGLPAS  GNLQLDTATG  VISGTAAVGD1920
LGTHTVVLTA  TNAIGASAPV  TLTLTVELPP  ALSAPVALPA  TGETTTGFIA  RWEAVTGADS1980
YRLDVATDAG  FTSLVSGYGD  LNIGTMTGRM  VTGLSADTDY  YYRVRAVNEA  GPSASSNTGA2040
ARTASSEVVL  VDDSFNDTDR  IGGFDGTSTS  SSSPAINTPT  SANTQWVIGN  AGQLIATTGG2100
MNWNFLVTNA  VSALGYFPTV  NVANGTTVTL  RLKFTTGTLG  GATSGNNFRI  VMIDSSPNGY2160
RQTDGAGSTA  DPFIGDKGYA  FFMPSPVAGA  STMPVTLQSF  KRTALTSDNL  FGSDASWTRS2220
NSVTQADGHR  FASNTAYTLT  ITLTRSSATS  ITTNAVITGG  NFDNLICEIA  DADTPVTKFD2280
TLGLRFGAGI  NQFNQITLNS  LRITTTGSSE  VTEPPVITSA  LTASATRGAA  FSYTIVADNV2340
PTSFTAEGLP  SGLELETSTG  VISGTPTATG  SYAVTIGAHN  AIGSDTRELI  ITVTAGGSDI2400
TTIVPPSGGL  TSPASTVFDA  AGNAYIADIA  AGAIMKVAGD  GTVTTFATIP  QLAVVAADSS2460
GNLYAAGNDG  NVTKILADGT  VVSPALATGV  TTPGGIAVDS  DGNVYVSKTA  SNTIVKITPA2520
GAVSTLAGSG  SAGSADATGD  AASFNGPTGL  ALNGNTGTLY  VADTVNCTIR  AIDLATGTVT2580
TVAGRAGVAG  DIGSEGSDGK  ATDGTLDTPE  AITIDAAGLL  YIADTGNNLI  RGFDPVSGAL2640
TTLAGDSGSI  TLVAPAGLAF  NPVSGLLNVA  DTGNGALRAV  TIKPVIAAQI  VDRIAKLGTT2700
VTLDGTAWAS  PAASYQWSVH  GTALAGSEAT  ITINVKSVTD  SGVYTIAASN  TAGESTAGMR2760
LTVTGNDSTQ  GPNDNSPNMN  DSGGGGGAPS  LWILGAMALL  ALVRKFSARR  MPAKLLPLLV2820
FLSFLAIHTS  PFAIAQQATP  SAELPPDDEI  ITMSAFEVTG  QSIKGYTASE  SVTGTRVASL2880
LRDLPFNVNV  VTDEFIADFN  AFDLADQLSN  VSSFSPSENI  GQFQLRGFEA  STQLVDGFRR2940
VGLTGVTVTD  RVEVIKGPAA  SIYGAIQPGG  AVNTLRKKPA  AKPKYGLTLG  VGTHDQARAS3000
FYATGPVGNS  KKLFYRLDTE  YRRTERQQEF  TRTRNGYAAL  QLAYKPTSRT  TLSVFIDHAD3060
RHDHPVSQLA  TSAARVDIGN  LPSWFPYDTS  DLRRTWAKYF  TQYFAQDFDY  YDMNFYGPTA3120
AKYSRLTSGS  VTLDHKVNSL  WSIRASFNMS  TNLSHTENAN  IGYYPFGYGV  INAATTEPPT3180
AEVRITPKHA  ETTNKATGFQ  LDNLFRFDTG  PIKHQLLVTG  DYYRNSSREF  SATWSNAFFY3240
DPADPYNLAG  NPSYASWDYA  TWDDDRSPYN  RVGDNSKVIN  RNYGLFVSER  ATMFKGRLIA3300
MAGVRYDYVD  CTATHMPTDD  NYTTKVVDYS  PDSWTYQLGL  TAVINRNITA  YVNASSAFDP3360
QPQLDEYDNP  LPNKESDGYE  FGFKFTLFSE  ALNITLNRFY  IRQENLTYSV  NDPETGQKET3420
IVTGEQKAKG  YEIDFNWQLT  RSLNIIGGYG  YVDAEITDAG  KLNWLNNTTP  RRVPKHNLGI3480
SVRYEFVSGP  LKGLFATGGA  TYYSKSLVNA  GSGYNITPYK  GTEDFNRMSQ  ELIYNVRFPN3540
GGLPYPYLPE  NAIVSYFTPA  SGSTPAMLYW  TDNQGATTVD  ELKKYSYASP  YLNGAVYVID3600
GRTQIYNRSS  VVWKMGVGYK  FKARGFGKKL  SHKIQVNMNN  VFNEKSTIGG  GIPILERNVM3660
VTYSVTF3667

Predicted CAZyme domains from dbCAN; Download help

Domains were colored according to CAZyme classification: (AA), (CE), (PL), (GH), (GT), (CBM), & (Null)

dbCAN3 server is a web server for automated Carbohydrate-active enzyme ANnotation.

Details:
dbCAN3 server integrates three state-of-the-art tools/databases for automated CAZyme annotation:
⋆HMMER search for CAZyme family annotation vs. dbCAN CAZyme domain HMM database
⋆DIAMOND search for BLAST hits in the CAZy database
⋆HMMER search for CAZyme subfamily annotation vs. dbCAN-sub HMM database of CAZyme subfamilies (derived from eCAMI classification of CAZyDB families)

For more details, please see dbCAN3.

Similarites between the same cluster seqeunces from DIAMOND; Download help